今天(2019-09-30)重装了最新版本的R和RStudio,版本号分别是R version 3.6.1 ,RStudio-1.2.5001。
本来打算按教程 【R包选择镜像以及本地安装:https://blog.csdn.net/qq_29300341/article/details/53229215】 来安装biocLite.R脚本,但是按旧方法装不上了。
报错信息:
报错信息中提示参考https://bioconductor.org/install/,原来是在R version 3.5及以上安装Bioconductor包的方法改变了。
R version 3.5以上Bioconductor安装方法:
1.安装Bioconductor:
这里安装要等比较久
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
2.检查是否安装Bioconductor成功:
BiocManager::available()
3.bioconductor选择镜像:
选用中科大镜像
options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
4. BiocManager加载库的方法
library(BiocManager)
BiocManager::install('devtools')
我尝试安装devtools这个包
5. 测试安装包是否加载成功
library(devtools)
加载成功
ps:
终于安装上BiocManager了,接着打算学下 【ComplexHeatmap 绘制肿瘤突变分布图:https://www.cnblogs.com/yuwq/p/11504840.html】
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旧版本R安装包方法出错参考:
0050-【R系统】-解决bioconductor下载安装问题:https://blog.csdn.net/leadingsci/article/details/80780922
bioconductor安装R包出现连接问题:https://www.jianshu.com/p/5076e8c82bab
R包选择镜像以及本地安装:https://blog.csdn.net/qq_29300341/article/details/53229215
解决新版本R3.6.0不能加载devtools包问题:https://www.cnblogs.com/lynn-home/p/10801221.html