python中调用R语言通过rpy2 进行交互安装配置详解(R_USER、R_HOME配置)

本文详细介绍了如何在python中调用R语言,通过rpy2库进行交互操作。首先,文章讲解了R语言的安装和环境变量配置,接着阐述了rpy2的pip安装或源代码安装方法,并验证安装成功。最后,针对pycharm中使用R语言遇到的R_USER和R_HOME配置问题,提供了详细的解决步骤,强调了环境变量设置的重要性。

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python中调用R语言通过rpy2 进行详解

1.R语言的安装:

https://jingyan.baidu.com/article/d8072ac49c3521ec94cefd55.html

大家根据上面的网址进行R语言的安装,在安装好R后,需要配置环境变量R才能进行使用。

对此电脑右键->选择高级设置->环境变量->PATH->编辑:

在这里插入图片描述

然后进行环境变量的编辑,这里我们在环境变量中加上R的安装路径:

在这里插入图片描述

这是我们使用管理者打开:输入R;即可:
在这里插入图片描述

出现如上界面代表R语言安装成功。这是R与python进行交互的第一步.

2.Rpy2工具的安装和配置

首先可以使用 pip install rpy2

如果不行就使用源代码安装,

### 如何在 Python 中集成或调用 R 语言工具与包 #### 安装 rpy2 库 为了使 Python 能够调用 R 语言的功能,可以借助 `rpy2` 库来完成这一目标。以下是关于如何安装配置该库的具体方法。 对于 Windows 用户来说,在安装之前需要设置环境变量以便让系统识别 R 的路径以及 Python 和 R 的交互位置。可以通过如下命令设定环境变量: ```bash os.environ['R_HOME'] = 'C:/Program Files/R/R-4.0.3/' os.environ['R_USER']='C:/Program Files/Python37/Lib/site-packages/rpy2' ``` 上述代码片段展示了如何定义必要的环境变量以支持后续操作[^1]。 接着,进入适合的 rpy2 文件路径之后,利用 pip 工具执行安装过程就变得简单明了了;当然这一步骤的前提条件是你已经依据自己的计算机架构选择了恰当版本的 rpy2 源码或者预编译好的 whl 文件[^2]。 另外一种方式则是下载对应平台上的 wheel (`.whl`) 格式的二进制分发版文件并将其放置于指定目录之中再手动加载至 PyCharm 或者其他 IDE 当中的 Project Interpreter 下面作为第三方模块引入使用[^3]。 #### 使用 rpy2 实现基本功能 一旦成功完成了以上步骤,则可以在脚本里轻松导入所需组件从而开启跨编程语言协作之旅啦! 下面给出一段简单的例子展示怎样通过 python 来运行一些基础统计分析任务: ```python import rpy2.robjects as robjects # 创建一个向量对象v robjects.r(''' v <- c(1,2,3,4) ''') print(robjects.globalenv['v']) ``` 此段程序首先创建了一个名为 "v" 的数值型矢量,随后打印出来验证其存在性。 --- ### 注意事项 尽管本文提供了较为详尽的操作指南,但在实际部署过程中仍可能遇到各种意想不到的技术难题,比如不同操作系统之间的兼容性差异等问题都需要额外关注处理才行哦~
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