MATLAB将矩阵保存为TIFF并使用ImageJ查看

最近的一个科研项目需要用ImageJ查看SNR map，所以需要将SNR map保存为TIFF格式。记录一下方法。

imwrite(uint16(matrix),filepath)

有两个小的注意点

1. 如果直接用savefig的话，用ImageJ查看时看到的是这一点对应的颜色RGB值而不是信噪比，所以要用imwrite
2. 注意matrix中数值的范围，如果是0-255可以用uint8

使用imwrite可以简单的保存uint16类型的数组，但是如果是single或者double可以用如下的function保存为TIFF。
完整的一个matlab function如下，X是需要保存的二维数组。

function t = saveAsTiffSingle(X, filepath)
% https://www.cnblogs.com/lionyiss/p/9552979.html
    im = single(X);
    t = Tiff(filepath,'w');
    tagstruct.ImageLength = size(im,1); 
    tagstruct.ImageWidth = size(im,2);  

    tagstruct.Photometric = 1;

    % 每个像素的数值位数，single为单精度浮点型，对于32为系统为32
    tagstruct.BitsPerSample = 32;

    tagstruct.SamplesPerPixel = 1;
%     tagstruct.RowsPerStrip = 16;
    tagstruct.PlanarConfiguration = Tiff.PlanarConfiguration.Chunky;

    tagstruct.Software = 'MATLAB';

    tagstruct.SampleFormat = 3;
    t.setTag(tagstruct)

    t.write(im);

    t.close
end