阈值调优是数据科学中一个重要且必要的步骤。它与应用程序领域密切相关,并且需要一些领域内的知识作为参考。在本文中将演示如何通过阈值调优来提高模型的性能。
用于分类的常用指标
一般情况下我们都会使用准确率accuracy来评价分类的性能,但是有很多情况下accuracy 不足以报告分类模型的性能,所以就出现了很多其他的指标:精确度Precision、召回率Recall、F1 分数F1 score和特异性Specificity。除此以外,还有 ROC 曲线、ROC AUC 和 Precision-Recall 曲线等等。
让我们首先简单解释这些指标和曲线的含义:
精确度Precision:所有正例中真正正例的数量。P=TP/(TP+FP)
召回率Recall:正例数超过真正例数加上假负例数。R=TP/(TP+FN)
F1 分数F1 score:Precision 和 Recall 之间的调和平均值。
特异性Specificity:真负例的数量超过真负例的数量加上假正例的数量。Spec=TN(TN+FP)
(ROC) 曲线:该曲线显示了真正例率和假正例率之间的权衡。代表模型的性能。
ROC曲线下面积(AUC):ROC曲线下面积。如果这个面积等于 1,我们就有了一个完美的分类器。如果它等于 0.5,那么就是一个随机的分类器。
Precision-Recall曲线:这条曲线显示了不同阈值下的精度和召回值。它用于可视化 Precision 和 Recall 之间的权衡。
一般来说,我们必须考虑所有这些指标和曲线。为了将这些内容显示在一起查看,这里定义了一个方法:
def make_classification_score(y_test, predictions, modelName):
tn, fp, fn, tp = confusion_matrix(y_test, predictions).ravel() # ravel() used to convert to a 1-D array
prec=precision_score(y_test, predictions)
rec=recall_score(y_test, predictions)
f1=f1_score(y_test, predictions)
acc=accuracy_score(y_test, predictions)
# specificity
spec=tn/(tn+fp)
score = {'Model': [modelName], 'Accuracy': [acc], 'f1': [f1], 'Recall': [rec], 'Precision': [prec], \
'Specificity': [spec], 'TP': [tp], 'TN': [tn], 'FP': [fp], 'FN': [fn], 'y_test size': [len(y_test)]}
df_score = pd.DataFrame(data=score)
return df_score
“预测概率”技巧
当我们测试和评估模型时,将预测的 Y 与测试集中的 Y 进行比较。但是这里不建议使用 model.predict(X_test) 方法,直接返回每个实例的标签,而是直接返回每个分类的概率。例如sklearn 提供的 model.predict_proba(X_test) 的方法来预测类概率。然后我们就可以编写一个方法,根据决策阈值参数返回每个实例的最终标签。
def probs_to_prediction(probs, threshold):
pred=[]
for x in probs[:,1]:
if x>threshold:
pred.append(1)
else:
pred.append(0)
return pred
如果设置thresh = 0.5 那么则和调用 model.predict(X_test) 方法得到的结果是相同的,但是使用概率我们可以测试不同的阈值的性能表现。
如果改变阈值则会改变模型的性能。这里可以根据应用程序领域选择一个阈值来最大化重要的度量(通常是精度或召回率),比如在kaggle的比赛中经常会出现thresh = 0.4xx的情况。
选择重要的度量
最大化的重要指标是什么呢?如何确定?
在二元分类任务中,我们的模型会出现两种类型的错误:
第一类错误:预测Y为True,但它实际上是False。也称为假正例错误。
第二类错误:预测Y为False,但它实际上是True。也称为假负例错误。
错误分类实例的数量决定了模型的好坏。但这些错误并不同等重要,对于不用的领域有着不同的要求,比如医学的检测和金融的风控中,需要尽量减小假负例也就是避免第二类错误,需要最小化假负例的数量,那么最大化的重要指标是召回率。
同理,如果要避免第一类错误,我们需要最小化假正例的数量,所以最大化的重要指标是精度。
为了最大化指标,我们可以移动阈值,直到我们在所有指标之间达成良好的平衡,这时就可以使用Precision-Recall曲线,当然也可以使用ROC曲线。
但是要说明的是,我们不能最大化所有指标,因为通过指标的定义就能看到这是不可能的。
阈值优化
假设我们正在处理一个二元分类任务的逻辑回归模型。我们已经进行了训练、超参数调优和测试阶段。该模型已经过交叉验证。也就是说,基本上能做的事情我们都已经做了,但是还是希望能够有一些其他的方式来优化模型,那么则可以试试调整模型的阈值。
对于sklearn来说使用model.predict_proba(X_test)方法来获得类概率,如果使用神经网络的化一般都会输出的是每个类的概率,所以我们这里以sklearn为例,使用这个概率值:
计算ROC AUC,它等于0.9794
计算并绘制ROC曲线
计算并绘制精度-召回率曲线
下面的代码块表示这些步骤:
def probs_to_prediction(probs, threshold):
pred=[]
for x in probs[:,1]:
if x>threshold:
pred.append(1)
else:
pred.append(0)
return pred
# getting predicted probability values
probability = model.predict_proba(X_test)
# calculate ROC AUC score. AUC = 0.9794
print("Logit: ROC AUC = %.4f" % roc_auc_score(y_test, probability[:, 1]))
# calculate and plot the ROC curve
model_fpr, model_tpr, _ = roc_curve(y_test, probability[:, 1])
plt.plot(model_fpr, model_tpr, marker='.', label='Logit')
plt.xlabel('False Positive Rate')
plt.ylabel('True Positive Rate (recall)')
plt.legend()
plt.title("ROC Curve")
plt.show()
# calculate and plot the Precision-Recall curve
model_precision, model_recall, thresholds = precision_recall_curve(y_test, probability[:, 1])
plt.plot(model_recall, model_precision, marker='.', label='Logit')
plt.xlabel('Recall')
plt.ylabel('Precision')
plt.legend()
plt.title('Precision-Recall Curve')
plt.show()
下图的曲线。可以看到模型的性能很好。
在本例中,假设在我们的实际应用中FP的成本> FN的成本,所以选择一个阈值在不降低召回率的情况下最大化精度。使用Precision-Recall曲线来对一个可能的阈值进行初始选择。在下面的代码中,绘制了带有候选阈值的Precision-Recall曲线。
plt.plot(model_recall, model_precision, marker='.', label='Logit')
plt.plot(model_recall[43000], model_precision[43000], "ro", label="threshold")
plt.xlabel('Recall')
plt.ylabel('Precision')
plt.legend()
plt.title('Precision and Recall values for a chosen Threshold')
plt.show()
这样就可以使用选定的阈值来获得最终的分类标签并计算性能指标。并且可以多次进行选择不同阈值进行对比。
print("Threshold value = %.4f" % thresholds[43000])
# results with the chosen threshold
predictions = probs_to_prediction(probability, thresholds[43000])
make_classification_score(y_test, predictions, "logit, custom t")
下图中可以看到,所选的阈值以召回率为代价来最大化精度。根据我们应用的决策阈值,相同的模型可以表现出一些不同的性能。
通过调整阈值并进行结果的对比,一旦对结果满意,模型就可以投入到生产中了。
总结
为分类模型选择最重要的评价指标并不容易。这种选择通常与应用程序领域有关,必须考虑错误分类的代价。在某些情况下,可能有必要咨询领域专家确定哪些错误代表最大的风险。
模型的行为很大程度上受到阈值选择的影响,我们可以应用不同的技术来评估模型并调优阈值以获得预期的结果。
作者:Edoardo Bianchi
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