【bioinfo】生物信息学——代码遇见生物学的地方

最新推荐文章于 2022-01-29 16:57:38 发布
最新推荐文章于 2022-01-29 16:57:38 发布
阅读量349 收藏 1
点赞数
分类专栏： 方法论
ly969434341
关注
  • 0
    点赞
  • 踩
  • 1
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
专栏目录
生物信息学处理相关代码
11-16
The Python code and supporting material, including example data files, are available as a single ZIP compressed archive. This must be uncompressed before use and will extract into a folder (directory) called "PythonForBiology", inside which the Python files, ending in ".py", and various sub-folders can be found. This arrangement of files and folders will allow the Python code to run directly from inside the uncompressed "PythonForBiology", i.e. the locations of any modules or data files mentioned in the code (and book) are specified relative to this location. The "examples" sub-folder contains all of the data files that are used as examples to support the Python code described in the book. The "databases" sub-folder relates to Chapter 20 and contains SQL and Python files sub-divided into sections to support both SQLite and MySQL database implementations. The "speedy" folder relates to Chapter 27 and contains code relevant to the binding of fast functions written in the C or Cython languages, including any files required for compilation. Many of the book chapters have a corresponding Python file containing the completed scripts and programs for that chapter. These files may be run directly as Python to test the code they contain. Note that several of these files will not work isolation, given that they import functionality from the others, which are assumed to be in the same folder. Chapters 1-4 and 10 do not have a corresponding Python file given that they only discuss the code in terms of short or incomplete fragments.
生物信息学
01-09
生物信息学
matlab如何敲代码-Python4Bioinformatics2020:Python4生物信息学2020
05-23
matlab如何敲代码适用于生物信息学的Python Python for Bioinformatics的简介-可在上找到。 归因 这些教程是对“数学入门Python”的改编，可从http://www.python.com/获得。 原始版本由Rajath Kumar编写，可在上找到。 由EANBiT赞助的Pwani大学MSC生物信息学和分子生物学课程对这些笔记进行了很大的修改和更新。 Jupyter笔记本快速入门 在整个课程中，我们将使用Jupyter Notebooks。 尽管您将使用的HPC具有Jupyter设置，但仍提供了这些说明，供您在计算机中进行设置。 介绍 Jupyter Notebook是一个交互式计算环境，使用户能够编写笔记本，其中包含完整且独立的计算记录。 这些笔记本可以更有效地共享。 这些笔记本可能包含： 现场代码 互动小部件 情节 叙述文本 方程式 图片 视频 值得一提的是，“ Jupyter”是一个宽松的首字母缩写，意思是Jul​​ia，Python和R。 Jupyter支持的主要语言。 笔记本可以允许计算研究人员创建其研究的可复制文档。 由于生物信息学是以数据
生物信息学软件汇总
09-22
各种生物信息学分析的软件汇总，蛋白质一二三级结构预测、
生物信息学常用数据库
热门推荐
wish_to_top的博客
07-08 1万+
写在前面 说来惭愧，感觉读到研究生，说来说去张口闭口也就是TCGA、GEO、ARRAYEXPRESS、GTEX数据库，感觉还不如一些临床医生自学生物信息学的，平常都没去探索一些新的数据库，这边做个记录.黑色部分代表我查到的简介，而红色部分则表示我的个人看法 GEO数据库 GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS，是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，目前已经发表的论文中涉及到的基因表达检测的数据可以通过这个数据
【哈佛大学：计算生物学 & 生物信息学】学习记录（一）
陈有朴的博客
01-29 1984
第一部分 —— 关于计算生物学 & 生物信息学 & 本课程内容 （1）Protein Wave 【技术】Sanger测序了一个蛋白质序列 【算法】Needleman-Wunsch algorithm 【数据库】PDB（Protein Data Bank，蛋白质3D结构数据库） 【算法】BLAST —— instead of pairwise sequence alignment 【比赛】CASP —— predicting the protein structure 【数据库】BLOCKS
Bioinfo Overview | 生物信息学从哪里来？又往哪里去？
Ginger2330的博客
11-11 455
什么是生物信息学 Bioinformatics is a data science that investigates how information is stored within and processed by living organisms. 生物信息学是面向计算的新生命科学领域。它的主要目标是了解活生物体内存储的信息。生物信息学依赖并结合了生物学，计算机科学和数据分析的概念和方法。生物信息学家主要根据他们通过数字解析基因组信息对生物过程产生的新见解来评估和定义其成功。 Bioinfo
生物信息学 陈铭_生物信息学Bioinformatics-山东大学课程中心.PDF
weixin_30500365的博客
12-23 1476
生物信息学Bioinformatics-山东大学课程中心生物信息学Bioinformatics巩晶癌症研究中心山东大学基础医学院2016.09.0877PERSONALINFORMATION姓名： 巩晶年龄：根据下图自己猜性别： ♀ 0531187****0828CRC_BIOINFOgongjing@1983年 ...
生物信息学简明教程 等两本
06-10
生物信息学培训教材（北京华大基因研究中心） 生物信息学简明教程
bioInfo:生物信息学项目
06-04
生物信息 生物信息学项目由： Opsommer 苏菲 瓦蒂隆·蒂博
bioinfo:各种生物信息学工具
05-27
生物信息学工具每个子文件夹中提供了更多详细信息。MLGtest.R根据观察到的独特多基因座基因型的数量来测试人群中无性繁殖的发生。 这是非常保守的，请参阅自述文件中的一些注意事项。 pileVar.pl识别变体基于从...
Bioinfo_c_Scripts:生物信息学的C脚本
03-13
Bioinfo_c_Scripts生物信息学的C脚本nt_count.c 打印输入序列的核碱基组成用法$ gcc nt_count.c -o nt_count$ ./nt_countnt_histogram.c 打印输入的DNA序列的核碱基组成的水平直方图用法$ gcc nt_histogram.c -o nt_...
生物信息python中文版.pdf
12-19
生物信息分析&&python脚本开发，适合生物信息行业的编程爱好者。
pre_o_1csdn63m9a1bs0e1rr51niuu33e.a
最新发布
05-15
pre_o_1csdn63m9a1bs0e1rr51niuu33e.a
matlab建立计算力学课程的笔记和文件.zip
05-15
matlab建立计算力学课程的笔记和文件.zip
FT-Prog-v3.12.38.643-FTD USB 工作模式设定及eprom读写
05-15
FT_Prog_v3.12.38.643--FTD USB 工作模式设定及eprom读写
matlab基于RRT和人工势场法混合算法的路径规划.zip
05-15
matlab基于RRT和人工势场法混合算法的路径规划.zip
14125@CoffeeRefill MINGW64 ~ $ git clone http://guanxiongcs.synology.me:9080/bioinfo_basic/CodeLib git clone http://guanxiongcs.synology.me:9080/bioinfo_basic/DataCenter fatal: destination path 'CodeLib' already exists and is not an empty directory. Cloning into 'DataCenter'... fatal: unable to access 'http://guanxiongcs.synology.me:9080/bioinfo_basic/DataC enter/': Failed to connect to guanxiongcs.synology.me port 9080 after 21031 ms: Couldn't connect to server
07-13
根据您提供的信息，看起来您已经在当前目录中有一个名为 'CodeLib' 的文件夹，并且 Git 克隆命令无法创建一个名为 'DataCenter' 的文件夹，因为连接到 'http://guanxiongcs.synology.me:9080' 的服务器失败。...

“相关推荐”对你有帮助么？

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值