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原创 用R做线性回归

一、求线性回归1、手动取两个点做线性回归,plot_ss(x = mlb11$at_bats, y = mlb11$runs, showSquares = TRUE)结果输出斜率、截断值和平方和2、自动求最小残差平方和时的线性回归,m1 以runs为y变量,以at_bats为因变量二、模型诊断1)线性检验

2015-11-16 10:37:19 905

原创 BeautifulSoup的使用学习笔记

中文教程:http://www.crummy.com/software/BeautifulSoup/bs4/doc/index.zh.html#id5在ubuntu下运行Beautiful Soup将复杂HTML文档转换成一个复杂的树形结构,每个节点都是Python对象,所有对象可以归纳为4种: Tag , NavigableString ,BeautifulSoup ,

2015-10-30 20:48:52 445

原创 正则表达式内置属性及分组

全文在云课堂http://study.163.com/course/courseLearn.htm?courseId=302001#/learn基础上学习得1、re.S:使 .匹配包括换行在内的所有字符 2、re.I :使匹配对大小写不敏感3、re.L:使本地化识别(local-aware)匹配(不介绍)4、re.M:多行匹配,影响^ 和$5、re.X :对

2015-10-29 20:53:16 466

原创 正则表达式之元字符及函数使用

字符匹配普通字符元字符:[ ]:用来指定一个字符集可匹配其中任一个字符import rest="top tip tqp twp"res=r"t[io]p"re.findall(res,st)['top','tip']res=r"t[^io]p"re.findall(res,st)['tpq','twp']^:匹配行首或者除了某个字符集之外s="helllo w

2015-10-29 19:06:24 593

原创 lncRNA数据库和miRNA数据库

lncRNA- related databaseNoncoding RNA       http:/ /biobases. ibch.poznan.pl/ncRNA/ fRNAdb                    http:/ /www. ncrna.org/frnadb/ NRED                      http:/ /jsm- research. imb.

2015-10-26 14:45:27 12788

原创 利用R做Bootstrap统计分析

介绍一个做Bootstrap好用的R 函数,inference。先看看不用inference时的代码,假定取100个bootstrap样本boot_means = rep(NA, 100)for(i in 1:100){ boot_sample = sample(gained_clean, n, replace = TRUE) boot_means[i] = mean(boot

2015-10-24 14:38:28 9690 1

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