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RSS订阅原创 TRAmHap: 从亚硫酸盐测序数据中的DNA甲基化单倍型准确预测转录活性
脱氧核糖核酸（DNA）甲基化（DNAm）是一种重要的表观遗传机制，在染色质结构和转录调控中发挥作用。研究 DNAm 与基因表达之间的关系对于理解其在转录调控中的作用具有重要意义。文中的新型深度学习框架 TRAmHap就是为了研究DNAm与基因表达之间的相关性。脱氧核糖核酸（DNA）甲基化（DNAm）是一种基本的表观遗传修饰，通过转座元件抑制、基因印记和 X 染色体失活等机制，在胚胎发生和衰老等多种生物过程中发挥着关键作用。
2023-11-05 18:43:12
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原创 DeePromClass:利用深度神经网络预测真核核心启动子的工具
DNA构成生命的源代码，基因的时空表达由转录程序承担。核心启动子是DNA的一个小片段。在真核生物中的核心启动子通常以大量同源序列基序为特征，特别是TATA盒、Inr元件(启动元件)、BRE (TFIIB识别元件BREu和BREd)、DPE(下游启动子元件)和暂停按钮等。精确定位于转录起始位点[2]、[3]、[4]、[5]、[6]、[7]。它们还含有独特的结构信号和非规范启动子结构基序，即低稳定区、a -链和非b - dna基序[2]、[8]、[9]、[10]、[11]、[12]、[13]。
2023-08-26 19:46:42
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空空如也
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