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原创 记录贴---使用cd-hit对orthofinder的准备数据进行预处理
记录贴—使用cd-hit对orthofinder的准备数据进行预处理在orthofinder运行后,我又遇到了新的问题—orthofinder的结果文件没有gene_tree文件,为此,我又试了三次,每次都对命令进行一些修改,大约花费了一个月的时间,但结果依旧不如人意,经过一点一点的调整,我发现问题还是出现在fasta数据文件上。我这三次运行期间,日志文件都有如下警告:之前我用的去除冗余数据的脚本是从网上搜到的,但我感觉去除冗余的效果不是很好(数据处理前后大小变化不大)(当然可能是因为我看不懂脚本,
2020-07-08 13:15:10
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原创 记录贴---解决一个使用orthofinder时遇到的小问题
记录贴—解决一个使用orthofinder时遇到的小问题本人生信小白(连linux都不会的小白),最近想要做基因家族分析才开始接触orthofinder,小问题遇到很多,今天很开心解决了一个小问题,记录一下快乐的心情(估计大佬们看到要笑我了,大佬勿看)#使用orthofinder时遇到了如下问题$ orthofinder -hTraceback (most recent call last):File “/pub/anaconda3/bin/orthofinder”, line 3, in fr
2020-06-11 13:12:05
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空空如也
求助脚本cafetutorial_report_analysis.py在哪里找?
2020-11-28
(linux环境)使用phyml构建系统进化树的数据如何进行预处理?
2020-06-12
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