Bash 经验谈
一骑代码走天涯
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用 Bash 编写计数器(counter) 和 循环结构
https://linuxize.com/post/bash-increment-decrement-variable/原创 2020-11-24 16:37:27 · 2170 阅读 · 0 评论 -
【Bash】用 While-loop 逐行读取文件中的字符串
目录/Table of ContentWhile loop in bashReference/参考资料:大家好,我是一个喜欢研究算法、机械学习和生物计算的小青年,我的CSDN博客是:一骑代码走天涯如果您喜欢我的笔记,那么请点一下关注、点赞和收藏。如果內容有錯或者有改进的空间,也可以在评论让我知道。????While loop in bash有一个文档 test.txt::applebananacherrydurianeggplant然后用 bash 的 while-loop 把內原创 2020-11-20 02:03:50 · 338 阅读 · 0 评论 -
【Bash】Linux在一堆文件中grep含有某特定字符串的文件
目录/Table of Content问题情況Linux指令参考资料大家好,我是一个喜欢研究算法、机械学习和生物计算的小青年,我的CSDN博客是:一骑代码走天涯如果您喜欢我的笔记,那么请点一下关注、点赞和收藏。如果內容有錯或者有改进的空间,也可以在评论让我知道。????问题情況小生在处理生物信息类的DNA档案 (FASTA) 时,许多时候有用的已知的基因或者蛋白质只有那麽一两条,但就需要在成堆上千个FASTA文件里面去找所对应的是哪一个文件。因为已知序列是有特定编号的,所以小生喜欢用Bash直接原创 2020-11-18 16:29:25 · 344 阅读 · 0 评论 -
【Bash】wget 一键下载网页所有档案
标题原创 2020-07-01 21:19:33 · 312 阅读 · 0 评论 -
【Bash】如何用find指令刪除路径中属于某用戶的全部档案
目录/Table of Content问题情況Linux指令参考资料大家好,我是一个喜欢研究算法、机械学习和生物计算的小青年,我的CSDN博客是:一骑代码走天涯如果您喜欢我的笔记,那么请点一下关注、点赞和收藏。如果內容有錯或者有改进的空间,也可以在评论让我知道。????问题情況之前跑程序的时候,曾经遇到过一个问题:如果现在在一个公共路径中包含太多垃圾文件 (而且名字完全没有规律),多到已经影响自己帐号的空间的情況下,在不影响其他用戶的正常文件和逐个手动処理的前提下,应该怎样才能把它们刪除?例如原创 2020-07-31 13:45:32 · 97 阅读 · 0 评论 -
【Bash】 从string擷取substring的小指令
Bash环境的 cut 指令在一般的编程经历来说,手动从一个字串 (string) 撷取一个子字串 (substring) 是一个必不可少的动作,无论你是写 python, C/C++ 或者 Java 都一定试过。但是,如果今天你写的是 Bash 呢?Bash 有一个内置的指令 cut,加以善用便能帮助你的工作更快的完成。Command: cut -cN-M第一个方法是直接用 cut -N-M 的方式撷取想要的 substring, 当中 N 和 M 分别是==子字串在主字串的起始位置和终止位原创 2020-07-09 14:04:23 · 656 阅读 · 0 评论 -
【Bash】用 for-loop 完成拷贝批量文件名称到文字档 (txt) 里
$ ls /disk/rdisk08/yikylee/Justin_backup_by_Justin_20200518/01_QC_illumina/result/*.fastq/disk/rdisk08/yikylee/Justin_backup_by_Justin_20200518/01_QC_illumina/result/sample_96-QUALITY_PASSED_R1.fastq/disk/rdisk08/yikylee/Justin_backup_by_Justin_20200518/原创 2020-07-16 19:53:03 · 152 阅读 · 0 评论