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一骑代码走天涯
喜歡學習各領域知識的精神小伙
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有用的本地BLAST网站
https://github.com/seqan/lambda/wiki/BLAST-Output-Formatshttp://scikit-bio.org/docs/0.5.4/generated/skbio.io.format.blast6.htmlhttps://seqan.readthedocs.io/en/master/Tutorial/InputOutput/BlastIO.htmlhttp://www.metagenomics.wiki/tools/blast/blastn-output原创 2020-11-25 19:51:47 · 615 阅读 · 0 评论 -
【Bash】用本地 NCBI Blast 寻找FASTA的物种分类
update_blastdb.pl --decompress nt./ncbi-blast-2.10.1+/bin/blastdbcmd -entry all -db nt -out nt.fsacd //BLAST+/prog=//BLAST+/ncbi-blast-2.10.1+/bin#BLAST+ (blastn, v2.10.1)for fasta in ./tobe_blast_dir/*;do BNAME=$(basename $fasta); QUERY=${BN原创 2020-11-20 01:54:16 · 1674 阅读 · 0 评论