Linux:配置tigramite 环境,特别是解决[GPDC、CMIknn]运行问题

本文介绍了如何在Linux下无Bug地安装tigramite,特别是在配置conda虚拟环境中解决GPDC和CMIknn运行问题。首先从GitHub下载代码,然后在Linux终端创建并激活conda环境,确保非线性独立性方法如GPDC和CMIknn能正常运行。最后,文章提到基础包的安装和在遇到问题时如何寻求帮助,如在Github issues上反馈。
摘要由CSDN通过智能技术生成


前言

近期一直跟进的工作是High-recall causal discovery for autocorrelated time series with latent confounders,里面包含基于约束框架下的时序算法,包含提出算法:LPCMC、PCMCI、PCMCI+,baseline:SVAR-FCI、SVAR-RFCI等,并且有对应的独立性方法。本本旨在介绍如何在Linux下无Bug安装tigramite 环境。


创建conda虚拟环境

1、Github 下载代码:https://github.com/jakobrunge/tigramite

2、Linux:快捷键ctrl + alt +T 弹出终端,输入下面指令

conda create -n My_LPCMCI python
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