图深度学习实战
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机器学习爱好者,分享图神经网络在药物预测中的应用
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使用CSV文件建立PYG数据集,进行分子预测
使用自己的分子数据集(csv,sdf,mol2)来创建适用于PyG的任务。需要的第三方库rdkit, pytorch, pyg,在使用图神经网络进行任务是,我们有些仅仅使用轮子,所以要使用自己的数据集来预测某些指标。所以我们就需要用自己的数据集建立适合PyG的Dataset。PyG有两种方法建立数据集,一种是直接读到内存中去的InMemoryDataset,限制是你的内存大小,还有一种是建立比较大的数据集的Dataset。这次我主要向分享比较全能使用的Dataset。二.输出代码如下(示例):原创 2022-06-06 00:47:40 · 1223 阅读 · 2 评论 -
【实战】疾病-基因与图神经网络和图自动编码器的相互作用
使用图神经网络和图自编码器的分类原创 2022-05-04 22:27:03 · 1327 阅读 · 1 评论 -
使用图形注意网络进行欺诈检测
通过GAT简单建模实战原创 2022-04-23 00:02:49 · 2311 阅读 · 2 评论 -
使用图神经网络预测药物-药物相互作用
GNN预测药物与药物之间的关系,通过GraphSAGE模型来测试。原创 2022-04-21 00:32:00 · 4121 阅读 · 5 评论