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原创 脑PET图像分析与疾病预测挑战

讯飞脑PET图像分析与疾病预测挑战比赛,使用CNN(resnet18)的baseline进行联系

2023-07-22 19:20:11 185

原创 使用CSV文件建立PYG数据集,进行分子预测

使用自己的分子数据集(csv,sdf,mol2)来创建适用于PyG的任务。需要的第三方库rdkit, pytorch, pyg,在使用图神经网络进行任务是,我们有些仅仅使用轮子,所以要使用自己的数据集来预测某些指标。所以我们就需要用自己的数据集建立适合PyG的Dataset。PyG有两种方法建立数据集,一种是直接读到内存中去的InMemoryDataset,限制是你的内存大小,还有一种是建立比较大的数据集的Dataset。这次我主要向分享比较全能使用的Dataset。二.输出代码如下(示例):

2022-06-06 00:47:40 1114 2

原创 【实战】疾病-基因与图神经网络和图自动编码器的相互作用

使用图神经网络和图自编码器的分类

2022-05-04 22:27:03 1252 1

原创 使用图形注意网络进行欺诈检测

通过GAT简单建模实战

2022-04-23 00:02:49 2027 2

翻译 PyG创建数据集

通过PyG封装库,使用自己的数据来构建我们自己的数据集

2022-04-21 14:48:29 2212

原创 使用图神经网络预测药物-药物相互作用

GNN预测药物与药物之间的关系,通过GraphSAGE模型来测试。

2022-04-21 00:32:00 3844 5

翻译 PYG图卷积中的消息传递

图卷积网络中的消息传递,在PyG中实现。

2022-04-20 19:15:40 714

翻译 学习官方PyG文档

小白视角学习PyG文档,快速入门图深度学习。

2022-04-19 20:33:18 2568 4

转载 初学者:了解GPT

GPT什么是语言模型自编码(auto-enconde)语言模型自回归(auto-regressive)语言模型基于Transformer的语言模型Transformer进化GPT2概述GPT2详解输入编码多层DecoderDecoder中的Self-Attention详解Self-AttentionGPT2中的Self-AttentionGPT2全连接神经网络除了BERT以外,另一个预训练模型GPT也给NLP领域带来了不少轰动,本节也对GPT做一个详细的讲解

2021-09-19 14:52:05 3322 2

转载 初学者:了解BERT

BERT了解BERTBERT句子分类模型结构模型输出预训练任务:Mask Language Model与训练任务:相邻句子判断BERT的应用BERT特征提取上一节学了将Attention发扬光大的模型Transform,今天讲学习把Transform模型发扬光大的经典模型:BERT。BERT在2018年提出,BERT一出现就打破了多个自然语言处理任务的最好记录。BERT的论文发表不久,BERT团队就公开模型的代码,并且提供了基于大规模预训练的模型下载。BERT的模型代码和模型参

2021-09-17 21:21:36 511

转载 NLP中的Transform理解

Transform相关理论transform模型Transformer模型在2017年被google提出,直接基于Self-Attention结构,取代了之前NLP任务中常用的RNN神经网络结构,并在WMT2014 Englishto-German和WMT2014 English-to-French两个机器翻译任务上都取得了当时的SOTA。与RNN这类神经网络结构相比,Transformer一个巨大的优点是:模型在处理序列输入时,可以对整个序列输入进行并行计算,不需要按照时间步循环递归处理输入序列。

2021-09-15 20:20:45 1929

图深度学习通过GNN预测阿尔兹海默症(AD)

想要使用GNN简单建立分类模型预测阿尔兹海默症的人

2022-04-22

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