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RSS订阅原创 生物信息学入门——“山东大学生物信息学”学习笔记9编程基础与网页制作
Linux操作系统作为开源领域的核心，以其稳定性、灵活性和强大的命令行工具成为开发者和系统管理员的首选。掌握Linux基本命令是高效使用该系统的基础，能够帮助用户快速完成文件管理、进程控制等任务。Perl语言以其强大的文本处理能力和灵活性著称，特别适合系统管理、网络编程等领域。从变量定义到操作符使用，Perl的语法规则既简洁又功能丰富，为开发者提供了高效的编程体验。网页制作是互联网时代的基础技能，从前端开发的HTML标签到与后端CGI的简单交互，构建网页不仅是技术实践，也是创意表达的重要方式。
2025-05-27 22:06:23
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原创 生物信息学入门——“山东大学生物信息学”学习笔记10perl下载安装问题解决
官网网址：https://www.perl.org/小竹我是Windows系统，选择Strawberry Perl，因为这个是开源免费的，对开发者友好：面向需要灵活性和完整开发工具链的用户（如需要编译 CPAN 模块）。商业支持：提供免费社区版和付费企业版（企业版包含技术支持、安全审计等功能）。企业友好：适合企业环境，强调稳定性、预编译模块和简化部署。小竹我选了PDL版本，因为我相信我能用上比较复杂的功能（其实不一定），主要是电脑内存够用。不同版本差别如下，按需选择。
2025-05-27 17:08:40
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原创 生物信息学入门——“山东大学生物信息学”学习笔记8数据挖掘
数据库系统、机器学习以及相关工具如 WEKA 是生物信息中不可或缺的组成部分。数据挖掘通过从大量数据中提取有价值的信息，帮助决策者发现隐藏的模式和趋势。数据库系统为数据的存储、管理和检索提供了高效的基础设施。机器学习作为人工智能的核心领域，通过算法使计算机能够从数据中学习并做出预测或决策。WEKA 作为一个强大的数据挖掘工具，集成了多种机器学习算法，为用户提供了从数据预处理到模型评估的完整流程。本文将深入探讨这些主题，帮助读者理解其核心概念、主要任务及实际应用。数据挖掘，又称为数据库中知识发现。
2025-05-22 22:03:58
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原创 生物信息学入门——“山东大学生物信息学”学习笔记7统计基础和序列算法
在生物学研究中，数据分析和模型构建是理解复杂生物系统的关键工具。贝叶斯公式作为一种强大的概率工具，能够帮助研究者从有限的数据中推断出潜在的生物学规律。同时，灵敏度和特异度作为二元预测的重要指标，在生物标志物的筛选和疾病诊断中发挥着重要作用。此外，序列算法如后缀树的构建与应用，为基因组学和蛋白质组学的研究提供了高效的计算方法。本文将探讨这些工具在生物学中的具体应用，展示它们如何推动生物科学的发展。贝叶斯公式、灵敏度和特异度以及序列算法是生物学研究中不可或缺的工具。
2025-05-22 17:27:40
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原创 生物信息学入门——“山东大学生物信息学”学习笔记6基因组学与蛋白组学
基因组学作为现代生命科学的核心领域之一，近年来取得了突飞猛进的发展。随着高通量测序技术的不断革新，基因组学研究已经从基础科学逐步走向临床应用，特别是在精准医学领域展现了巨大的潜力。从疾病基因的发现到基于基因组的诊断和治疗，基因组学正在深刻改变医学实践的方式。然而，技术的进步也带来了新的挑战，如测序数据的准确性、计算资源的限制以及海量数据的存储与可视化等问题。本文将从基因组学的基本技术出发，探讨其在精准医学中的应用，并分析生物信息学领域面临的挑战，同时展望基因组学在古生物学等新兴领域的潜力。
2025-05-21 17:34:41
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原创 生物信息学入门——“山东大学生物信息学”学习笔记5蛋白质结构预测与分析
蛋白质是生命活动的重要执行者，其功能与结构密切相关。蛋白质结构从一级到四级，层层递进，决定了其生物学功能。随着计算生物学的发展，蛋白质三级结构的预测、可视化与分析成为研究蛋白质功能的重要手段。本文将从蛋白质结构的基本概念出发，介绍三级结构的预测方法、可视化工具以及相关计算技术，为蛋白质结构与功能研究提供参考。通过 VMD 等三维可视软件可以看到了蛋白质的立体三维结构。可以通过诸如 X 射线衍射法、核磁共振法、以及冷冻电子显微镜技术等实验方法获得。
2025-05-19 21:44:10
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原创 生物信息学入门——“山东大学生物信息学”学习笔记4分子进化与系统发生
进化是生命科学的核心主题之一，它揭示了生物多样性的起源与演变过程。从达尔文的自然选择理论到现代分子生物学的发展，进化研究不断深化我们对生命本质的理解。本文将从进化的基本概念出发，探讨系统发生树的构建方法，并通过MEGA7软件展示如何构建邻接树（NJ树），为读者提供一个全面的进化研究视角。进化研究不仅帮助我们理解生物多样性的形成机制，还为生命科学的发展提供了重要的理论支持。通过系统发生树的构建，我们可以直观地展示物种间的进化关系，揭示其共同祖先与分化过程。
2025-05-16 11:32:52
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原创 生物信息学入门——“山东大学生物信息学”学习笔记2生物数据库
一些常用生物数据库介绍提示：以下是本篇文章正文内容，下面案例可供参考生物数据库：被组织起来的大量生物数据，这些数据通过计算机可以被方便的访问、管理及更新。附：天文数字单位尧 yotta 1000000000000000000000000绎 zetta 1000000000000000000000艾 eха 1000000000000000000拍 peta 1000000000000000（千万亿)太 tera 1000000000000（万亿)
2025-05-09 16:33:30
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原创 生物信息学入门——“山东大学生物信息学”学习笔记1绪论
B站：山东大学生物信息学书籍：普通高等教育”十四五“规划 生物信息学 陈铭，2022，科学出版社绪论的内容。
2025-04-28 15:07:50
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