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原创 Linux如何在本地/服务器间传输文件

现在的很多远程连接工具比如XShell或MobaXterm都有提供上传和下载的功能,除此之外,一些Linux终端的命令比如scp、sftp也可以实现这类功能,并且更为灵活和便捷,不但可以满足本地与服务器之间的传输,也能在两台远程服务器之间相互传送文件。下面介绍scp的一些用法。

2023-07-15 20:04:37 3642 1

原创 如何在Ubuntu中安装和配置mysql

MySQL 是世界上最流行的开源数据库。根据 DB-Engines的调查数据,MySQL 是第二受欢迎的数据库,仅次于 Oracle 数据库。MySQL在过去由于性能高、成本低、可靠性好,已经成为最流行的开源数据库,因此被广泛地应用在Internet上的中小型网站中。随着MySQL的不断成熟,它也逐渐用于更多大规模网站和应用,比如维基百科、Google和Facebook等网站。

2023-06-10 23:40:41 1425

原创 一行命令清理Linux内存缓存

缓存(cache)是临时存储区域,用于存储经常访问的数据以供快速访问。 Linux 中的缓存称为页面缓存(Page Cache),Linux 缓存方法称为回写缓存(write-back cache)。

2023-06-10 23:37:48 559

原创 生信中常用的Linux文件操纵命令

生物信息学数据分析方面使用的最多的操作系统就是Linux,许多开源生物信息软件都是都是基于命令行的,并且是只有Linux的版本。尽管有不同的 GUI(图形用户界面)可用于生物信息学分析,但它们使用起来并不比在Linux上轻松。 因此,学习Linux命令是生物信息学数据分析的必备技能。这篇文章将介绍日常生物信息学数据分析所需的基本 Linux 命令。

2023-06-10 23:34:39 314

原创 序列比对简介1

序列比对是生物信息学中非常重要的一部分,它可以帮助我们识别DNA、RNA和蛋白质序列中的相似性和差异性,从而推测它们在生物体内的功能。

2023-05-02 19:05:18 830

原创 序列比对简介2

上期我们介绍了序列比对中的一些基本概念,包括匹配(match)、不匹配(mismatch)、替换(substitution)、间隔(gap)、插入(insertion)、删除(deletion)、全局和局部对齐(globalandlocalalignments),这期我们来对这些概念进行更为详细的描述。

2023-05-02 19:02:25 654

翻译 生物信息学的5个Level

对于生物信息学者来说,一般从1级的研究开始,学习基本的生信技术;等到计算和生物学知识掌握差不多之后,可以尝试想2级和3级进阶

2023-05-02 18:57:17 290

原创 ChatGPT帮助快速了解一个新领域

可以看到,ChatGPT首先简要地说明了Linux的由来,同时也提及了其他两个主流的操作系统,随后介绍了Linux的几个重要的特点:灵活性、稳定安全、版本众多,最后还给出了建议。虽然给出的几点建议都并没有从生物信息学的角度来阐明如何学习Liunx,并且也都是一些套话,类似于一个从一个模板中衍生出来的回答,但总体来说还是有点帮助的,至少可以让我们心中对于如何学Linux有个大概的认识。总之,面对一个全新的领域,ChatGPT是一件学习的利器,特别是在计算机科学这方面,它生成的内容基本上是可信的。

2023-04-03 20:11:48 151

原创 一些人工智能网站和工具

https://github.com/features/preview/copilot-x Copilot X,一款AI代码生成工具,可以帮助我们自动生成所需要的代码,大大提高了编程效率。其能根据前面已有的代码推测之后我们所需要写的代码,例如我给出了函数名,它就自动给我生成了函数的主体,省去了许多重复写代码的时间。https://yiyan.baidu.com/ 文心一言,百度开发的大型AI模型,随不及ChatGPT强大,但对中文信息处理在某些方面要更为可靠,目前还需要申请注册码才能使用。

2023-04-03 20:07:36 4501 1

原创 算法时间复杂度探析----以找出序列中最接近的两个数为例

用两种方法解决两数渐进问题,比较时间的复杂度。

2022-08-22 10:43:29 376

原创 Python重命名核酸截图文件

用Python实现核酸截图文件重命名,解放双手,提示工作效率!

2022-08-11 22:57:50 1686 1

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