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原创 R trycatch()后输出没有报错的数据的运行结果

一般我们都先用trycatch()抓取拟合失败的组,然后在运行正式拟合的时候要把拟合错误的组用if 跳过。可以看到,虽然这个脚本可以成功将拟合成功的行,但是对拟合失败的行,也就是failed_groups其实并没正常存储到failed_groups中。为什么当我在trycatch()前把一行数据设为true,在trycatch()中,当出现报错时我想进行把这个值改为false,但是不能成功呢?于是,最近我尝试把“纠错”和“出结果”两部分一起完成,终于找到了办法,但是脚本依然有些问题。

2024-05-21 15:32:14 160

原创 python入门系列——打印列表里的元组

分解这道题的意思,无非对于一个范围内的数字,先产生一个因数列表,对列表元素求和。然后比对在这个范围内有没有一个数A=B的因子列表之和,同时B=A的因子列表之和。这本质是列表推导式,for i,j in ret 实际上是遍历了列表中的(i,j)元组,由于print不可以返回一个值,所以这个列表推导式不产生新列表,而直接打印结果。且正整数B的全部因子(包括1,不包括B本身)之和等于A,A不等于B,则将正整数A和B称为亲密数。有时候,我们需要在结果列表中添加元组,得到的结果列表中,元素是元组。

2024-01-19 17:01:48 450 1

原创 python笔记——列表的应用

大概思路就是把输入的字符串s按需要切割的长度o逐个逐个字符开始切割,直到剩下o个切不动为止,然后看切割下来的片段总和是否与其中的单个元素×o的数目相同,这一步也许多写一重循环逐一遍历小片段中的元素×o是否结果都相同会比较好。如上面程序中li=[1,2,3,4,5,6,7,8,9,0],下标0号元素为1,而-1号元素为0。因为上面程序步长为二,所以输出结果为[1,3,5]。也就是输入数字3,又输入一串数字如1,1,1,2,3,4,4,4,5,5,5时,需要找出数列中连续出现3次的数字。

2023-12-16 21:11:54 828

原创 蛋白质分子演化和设计文献阅读笔记——5种原始氨基酸组成高可溶性的随机序列

推测地球上原始的氨基酸组成,可以帮助我们理解生命的起源。更加灵活可变的结构,而不是由具体结构的蛋白质,更加可能出现在演化的早期,并且在蛋白质数量还没演化到非常庞大时,通过诱导折叠,这些没有固定结构的蛋白质可以结合更多的底物,发挥多样的功能。为了能在实验室中创造出较为稳定以及可溶的蛋白,Nobuhide Doi等人想模拟分子早期的演化,用演化初期含量最丰富的5种氨基酸构建只含有这几种原始氨基酸的随机序列并鉴定其功能,或许从中能筛选出功能性蛋白,或一窥生命的起源,也为实验室合成新蛋白提供了借鉴和思路。

2023-12-16 13:26:28 1296

原创 蛋白质分子演化文献笔记——从随机序列中分离出功能蛋白

而设想一下,在原始汤中,分子的碰撞形成了寡肽,而在某个时刻,这些无序的小片段再不是长长短短的一条高聚合有机物,而是打了个卷,形成了一个空腔...蛋白质——生命功能的承担者,就这样诞生了。而为了解决上一节末提出的问题,作者决定创造一个已知大小的氨基酸随机序列文库,以能结合ATP为标准,筛选出具有该功能的蛋白质,估算随机序列之间产生某一功能的概率。自然界中可以实现ATP结合的蛋白中,找不出B家族这样的,只有在这个随机序列文库中产生了,也许极简序列要实现功能,通过金属离子辅助形成结构是最简单的方法。

2023-12-09 22:16:38 1506 1

原创 python入门笔记——字符串的应用1

已知ord("a")是97,所以在转换26-i+1时将ord(i)都减去96,把ascii序号转变为1~26的字母序列。题目大概是:要把密码中a→z,b→y,c→x... ...大写字母亦然,A→Z,B→Y,C→X... ...也就是把字母从第i个变成第(26-i+1)个,而非字母不用改变,从而实现加密。这道题通过新建字符串,新设立一个变量j来替换i,字母用ord()转变为ascii以及ascii用chr()转变为字母,就可以完成。使用新建字符串,也可以完成字符串的reverse(反向排序),如。

2023-12-02 17:00:07 384

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