PCA降维算法

主题：PCA简介及其应用

PCA，即主成分分析（Principal Component Analysis），是一种常用的数据降维算法。它可以将高维数据转换为低维数据，同时尽量保留原有数据的信息。本文将介绍PCA的基本原理、应用场景以及如何使用Python实现PCA算法。

一、PCA原理

PCA的主要思想是通过线性变换将高维数据映射到一个低维空间中。这个变换的目的是尽可能地减小数据的维度，同时尽可能地保留原始数据的信息。具体来说，PCA会找到一组新的坐标轴，使得数据在这些坐标轴上的投影方差最大。这些新的坐标轴被称为主成分，它们是原始数据的线性组合。

二、PCA应用场景

PCA在数据分析和机器学习中有广泛的应用，以下是几个常见的应用场景：

1. 数据降维：PCA可以将高维数据转换为低维数据，减小计算量和存储空间。

2. 数据可视化：PCA可以将数据投影到二维或三维空间中，方便数据的可视化。

3. 特征提取：PCA可以提取出最重要的特征，减小噪声对数据的影响，提高模型的准确性。

三、Python实现PCA算法

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
from sklearn.datasets import load_iris

#导入数据
iris = load_iris( )   #公开数据集
X=iris.data
# print(X)

#去中心化
X=X-X.mean(axis=0)

#相关系数矩阵
X_cov=np.cov(X.T,ddof=0)
print(X_cov)

#计算特征值和特征向量
m, k = np.linalg.eig(X_cov)
print(m)          #特征值
print(k)          #特征向量

# 计算主成分贡献率以及累计贡献率
sum_lambda = np.sum(m)  # 特征值的和
print(sum_lambda)

f = np.divide(m, sum_lambda)  # 每个特征值的贡献率（特征值 / 总和）
print(f)                      #依情况而定选择维数

# 前两大特征值对应的特征向量为：
m1 = k.T[0]
print(m1)
m2 = k.T[1]
print(m2)

# 计算主成分值已去中心化
z1 = np.dot(X, m1)
# print(m1)
z2 = np.dot(X, m2)
# print(m2)

# 输出降维后的结果（已去中心化）
mk = np.array([m1, m2])
# print(mk)
print(type(mk))
print(mk.T)                #第一主成分    #第二主成分

#绘制贡献率图像
lo=sum_lambda              #特征值的和
exp=[(i/lo) for i in sorted(W,reverse=True)]      #按照降序排列特征值
var=np.cumsum(exp)                       #累计贡献度
plt.bar(range(1,len(exp)+1),exp,alpha=0.5,align='center',label='individual var')       #绘制柱状图
plt.step(range(1,len(exp)+1),var,where='mid',label='individual var')       #绘制阶梯图
plt.ylabel('贡献率')      
plt.xlabel('主成分')     
plt.legend(loc='best')               
plt.show( )