Vector NTI 11.5.3| Win版 | 生物专业软件 | 安装教程

软件介绍

Vector NTI是一款生物技术研发功能型软件。

能帮助检测基因序列,进行相关项目的分析,Vector NTI目前广泛应用于生物科技领域,方便研发人员对序列进行分析演算。本次带来Vector NTI最新版PC客户端资源下载,软件安装包内附有详细的教程说明,欢迎广大用户朋友们下载体验。

Vector NTI特色

从AlignX出口分子

在文本窗格中选定的分子可以出口到GenBank、EMBL(GenPept蛋白质)(SWISS-PROT蛋白质),或为原序列Fasta文件。若要将分子导出到外部文件,请选择项目>导出分子,并在“文件保存”对话框中选择文件类型。

得分矩阵-- AlignX

设计成对序列比对评估的所有算法都是基于将分数分配给对齐残基的系统,检测不同序列之间的相似性。众所周知,某些氨基酸在其他相关蛋白质中很容易被其他氨基酸取代,这可能是因为它们具有相似的理化性质。根据氨基酸被替换为原始残基的相似性,这些“替换”被分配在矩阵中显示的分数。在对齐分数上相同或相似的残留物比那些不太相似的残留物高

比对Pcr分析报告

当搜索完成时,如果您在结果选项卡上检查了生成报告选项,则对齐PCR报告预览窗口显示分析结果。比对PCR分析报告对话框的外观和功能类似于多重PCR分析报告对话框。

关于点阵

点阵分析主要是比较两个序列来寻找所有可能的残基匹配的方法。该方法还可用于蛋白质和DNA序列中的直接或反向重复序列。它可以预测RNA中自我互补的区域,从而形成双链区或二级结构。

分析Bioannotator

Bioannotator是一套全面的蛋白质和核酸序列分析工具,超过五十种不同的预定义的蛋白表与特征映射和序列提供。Bioannotator还提供以下先进的搜索和分析工具,它是运行在分析监控:PROSITE,Pfam,块和蛋白水解裂解。

通过Web执行分析

Vector NTI使得它很容易把你的Alignx数据直接到公共网站已经建立了一个分子的三维结构,比较它与其他分子,特定功能的搜索,或进行基因预测,等等。

Vector NTI功能

分析GenomBench

Genombench是Vector NTI提前的基因组项目的主力。Genombench可以容纳一个碱基的基因组片段,可以检索从兼容的系统兼容的服务器上的数据,例如UCSC和Ensembl。它提供了浏览和查询这些网站使用关键词,界面两侧标记,BLAT(UCSC数据库)或SSAHA(的)。Genombench还提供以下先进的搜索和分析工具,它是运行在分析监控

对分子序列的操作

我们以一个DNA序列为例,进行一系列的常规分析;最后将此DNA序列翻译成氨基酸序列,并对此氨基酸序列进行各种分析。

对齐显示设置——Consensus Calculation Tab

一致性序列是一个理论上有代表性的核苷酸序列,其中每个核苷酸代表在同一位点上在同一位点上经常看到的残基,或由其他标准选择。“对齐设置”对话框中的“一致性计算”选项卡指定如何以对齐方式计算对齐窗格中作为底部序列的一致序列。

以点击作为特征输出查询分子

当您导出查询显示为特征的分子打成。GFF文件,使用点击功能GFF文件命令导出查询分子保存。GFF文件到外部位置(硬盘、软盘、网络等)。你可以打开一个。在一个Vector NTI分子视窗GFF文件并将其保存到Vector NTI数据库,如果需要的话。。GFF文件提供一个共享查询爆破方法打信息与其他Vector NTI用户分子格式。

模拟电泳

模拟电泳是指对DNA片段进行酶切分析后,通过电脑模拟电泳过程,将酶切片段分离。该功能有利于评估电泳时间,便于验证实际电泳结果的好坏。

软件安装

安装要点说明:

1、请尽可能使用windows操作系统内置账户Administrator来安装,已发现用非Administrator账户安装会安装失败或出现各种意外问题。

2、运行安装程序后直接“下一步、下一步、⋯⋯”,安装完成后重启计算机,最后把破解文件复制到安装后的程序文件夹下(默认为C:\Program Files\Invitrogen\Vector NTI Advance 11\),替换原文件即可。

3、用破解文件替换原文件后,打开Vector NTI,如果发现没有破解成功,请打开“Help”菜单中的“License Manager”,在Applications选项卡中,将所有程序后面的“Demo mode”,都改为“Dynamic license”。然后退出软件,下次打开时就能正常使用了。(是否破解成功的判断方法:Demo mode时(未破解成功),窗口右下角有个红色×;Dynamic license时,窗口右下角变成一个绿色的√。)

4、另外,打开QuickStart,选择Launch Local Database,选择View菜单下的Author Info,就能够修改用户名称。

5、更多使用技巧请查阅安装目录下的软件使用手册。

查看头像,后台回复:Vector NTI 

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好的,那么我可以为您生成一段计算京津冀地区夜间灯光指数的 Python 代码,使用的数据为 VIIRS 卫星遥感数据,计算方法为夜间灯光指数(NTI)。 首先,您需要准备 VIIRS 卫星遥感数据,数据格式为 GeoTIFF,可以使用一些地理信息系统软件(如 QGIS、ArcGIS 等)读取和处理。假设您已经准备好了数据,并将其存储为 TIFF 格式的文件。 然后,您需要安装一些 Python 库,包括 `numpy`、`rasterio` 和 `matplotlib`: ```python !pip install numpy rasterio matplotlib ``` 接下来是计算夜间灯光指数的代码: ```python import numpy as np import rasterio as rio import matplotlib.pyplot as plt # 读取 GeoTIFF 文件 file_path = 'path/to/your/file.tif' with rio.open(file_path) as src: data = src.read() profile = src.profile transform = src.transform # 计算夜间灯光指数(NTI) mean = np.mean(data) std = np.std(data) nti = (data - mean) / std # 将结果保存为新的 GeoTIFF 文件 output_file = 'path/to/your/output.tif' with rio.open(output_file, 'w', **profile) as dst: dst.write(nti) # 可视化结果 plt.imshow(nti, cmap='gray') plt.colorbar() plt.show() ``` 在这段代码中,首先使用 `rasterio` 库读取了 TIFF 文件,并获取了文件的元数据信息。然后计算了夜间灯光指数(NTI),并将结果保存为新的 GeoTIFF 文件。最后使用 `matplotlib` 库将结果可视化出来。 需要注意的是,这段代码只是一个简单的示例,您可以根据实际需要进行修改和优化。同时,如果您有任何问题或需要进一步的帮助,请随时告诉我。

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