想用conda安装最新版本的的salmon出现报错
conda Found conflicts! Looking for incompatible packages
之后是
ResolvePackageNotFound
libgcc-ng[version='>=12']
在网上查资料没有解决,问chatGPT说是要更新conda
再从网上查,发现更新conda有一定风险,因为担心现有其他安装环境崩溃,没有敢直接conda update conda
使用
conda search libgcc-ng
发现没有最高版本也是11开头的,没有12,
推测是现在的conda源没有更高版本的libgcc-ng
于是决定添加conda源
在网上找博客,随便测试了一个清华源
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
(备注,使用命令conda config --show-sources 可以看现有源有哪些)
添加了清华源后,再看libgcc-ng的版本就有大于11的了
再执行
conda install -c bioconda salmon=1.10.2
没有冲突报错了,顺利安装成功
还好没有更新conda或者做conda clean等风险操作~
备注:先为软件创建自己的环境,激活进入自己的环境后再安装哈
conda create --name salmon