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RSS订阅原创 Mac电脑画图报错 load failed for “Cairo‘:.onLoad failed in loadNamespace()
我是用 Mac 电脑 R 画图，需要用到 Cairo 包，但是我尝试多次都是报如下的错误。可能是 Mac 电脑需要另外下载一个软件。我最后是用别人的电脑跑成功的。
2024-03-22 13:55:31
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原创 GEO 数据库 GPL5188 平台的基因注释信息
不过只有 soft 文件，基因名在用 // 符号分割 的gene assignment 列。但是用来注释发现探针和注释包的 ID 并不一致。所以记录一下，这个数据最后也没注释成功。#GEO 数据库 GPL5188 平台的基因注释信息。
2023-08-19 11:22:13
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原创 ＜文献阅读＞用转移熵通过微阵列的时间序列推断基因调控网络(inferring gene regulatory networks from microarray time series data
这篇文章是2007的时候发表在IEEE杂志上，并没有收录到PubMed里面。是韩国的学者开发出来的方法。具体来说，通过转移熵计算基因对的因果关系(causal relations), 也就是转移熵的值。转移熵不是负数，而且大小代表因果关系的强度。##题目：Inferring gene regulatory networks from microarray time series data using transfer entropy##引入衡量两个变量的关系可以用相关系数、互相关、互信息。但是这些是对
2021-06-02 14:33:31
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原创 r语言安装r包
r语言安装r包2020首先根据r包存储的地方，就可以分为三种下载方式CRANbioconductorGitHub其他安装方式首先根据r包存储的地方，就可以分为三种下载方式cran，bioconductor还有GitHub。bioconductor一般都是生物信息方面的R包。github是代码的托管平台，很多软件，多种语言的程序包也都在这里发布。CRAN// CRAN里的r包下载代码install.packages("dyplr")注意这种方法只能够下载cran里的r包，如果r包在githu
2020-12-21 20:03:20
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原创 原文件内容更新及备份，特殊标量$^I和@ARGV学习笔记
#!/usr/bin/perluse strict;use warnings;my $filename="C:\\Users\\Chen\\abv.txt";$^I= ".bak";push @ARGV,$filename;while(<>){ s/haha/h/g; print;}<>钻石操作符会调用@ARGV数组（由命令行参数...
2020-02-12 19:54:29
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原创 技嘉G31主板学习笔记
中间黄铜色的印有GIGABYTE就是集成显卡。右边是cpu，摁下cpu左侧的杆，就可以打开cpu的盖子，拿下cpu。这个是技嘉G31主板，LGA775针的cpu。黄色长条的就是内存条，此主板是ddr2，最多两个内存条4G内存。依次向下，就是绿色的DVD盒与主板的线插口，与白色主板电源插口。再向左就是开机键、重启键与它们的指示灯的电源插口。再向左就是硬盘线的插口。向上，就是机箱前面的us...
2020-02-06 21:14:06
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原创 拆卸台式电脑主机，cpu，硬盘，内存条等
写在前面：家里有台九年的电脑，window xp系统，已经开不了机了。想升级下系统和硬件设施。所以先拆下来看看。1.从上至下，从左至右，依次是电源、DVD、主板、硬盘。2电源**电源内部3.DVD...
2020-02-06 17:55:06
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原创 安装Rtools的问题
用rstudio直接键入命令library（installr）install.Rtools（）直接安装Rtools设置环境变量Sys.getenv（“PATH”）#查看当前环境变量path<-c()path<-paste(,collapse=";")Sys.setenv(PATH=" ")#设置环境变量...
2019-12-08 15:39:05
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原创 下载r包IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19
BiocManager::install(“IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19”)用此命令下载r包IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19报错error：loading failed for ‘i386’记录一下
2019-12-08 15:26:24
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原创 安装部分bioconductor的r包报错‘i386’
处理ncbi上的甲基化数据，在下载r包时IlluminaHumanMethylation450kmanifest时，显示r与Windows的前后端停止工作。不论是biomanager下载还是压缩包解压都是这样报错。最后通过管之前下好的人要的文件成功做的。...
2019-11-27 23:13:37
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空空如也
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