SOM基于图的可视化

Unsupervised Spatiotemporal Analysis of FMRI Data Using Graph-Based Visualizations of Self-Organizing Maps 这篇文章中用到了SOM以及基于图的可视化，上一篇整理了SOM的知识，在此做基于图的可视化做笔记。

这篇文章中基于图的可视化主要是结合了两种技术：1）基于密度连接；2）基于关联连接

基于密度的连接使用连接矩阵CONNDD来表示，假定，mi和mj在SOM矢量原型中存在边界，也就是在输入数据中mi和mj是邻接的，他们邻接的权重使用连接强度表示：

CONNDD（i,j） = |RFij| + |RFji|   i,j = 1,2,3...N

在这里，以mi作为最佳匹配神经元（BMU），并且以mj作为第二好的匹配单元的输入向量的数目就是|RFij|的值。

然后将连接强度标准化，如果连接强度小于阈值，则作为异常值丢弃。

基于关联的连接使用相关系数矩阵CONNCC来实现，在网上计算相关系数的方法很多，这里不整理了。