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RSS订阅原创 Win下的caDNAno与Maya安装
安装环境：Win7，64位！安装过程中均默认路径，不要随意更改路径参考文章：Cadnano-windows-installation、PyQt for Maya 2015 64bit1. 安装python2.7.2cadnano-windows install,按照文中Ensure Python is installed安装python，添加环境变量2. 安装Cadnano2.2下载C...
2019-03-30 12:44:38
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原创 3. Pandas 使用手册（一）
此网页翻译整理自《python data science handbook》，基于python3Panda是基于Numpy的一个库，其数据类型之一 DataFrame 非常的高效。 DataFrame是具有行名和列名的多维数组。所有的数据都具有相应的label，且允许数据缺失。其另外一种数据类型为 Series。3.1 安装与使用Pandas安装Pandas之前需要安装Numpy，具体...
2018-10-16 16:03:06
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原创 Mac下使用Aspera Connect下载NCBI Sra 数据
Mac下使用Aspera Connect全速下载大型NCBI文件的方法1，下载安装SRA Toolkit DocumentationSRA Toolkit 下载2，下载安装Aspera Connect的dmg文件Aspera Connect3，建议使用prefetch命令下载prefetch, fastq-dump, vdb-dump的简介 prefetch 命令的使用简...
2018-10-15 15:34:00
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原创 KKT condition --- Karush–Kuhn–Tucker conditions
有关KKT条件，一直都看的云里雾里，但是还是很好奇其内在的逻辑，最后花时间整理了一下，有不足之处请指正。有关原问题和对偶问题的转化知乎回答解释的更详细。正文开始之前，介绍一些概念Duality，对偶性（1）比如极大极小问题和极小极大问题就是对偶问题，当把极大极小问题转化成极小极大问题来求解时，得到的最优解分别是d和p，那么最优解之间可能会存在一个差值，叫做duality gap。（2）当遵循强对偶...
2018-04-24 18:36:08
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原创 [Mac] R入门 五 语法特色
Google R style guide1，赋值符号 <-多值的赋值，c是combine，concatenate，convert, coercemy_vector <- c(1,1,2,3,4,5) #必须有c，且赋值的符号不是“=”my_vector <- (1:10) #此处连续的值的赋值可以不适用c，枚举的要有cmy_vector <- c(1,4,"hello"...
2018-04-16 20:35:37
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原创 [Mac] R入门 三 基础数据分析的一些简单方法
1，检查数据对象head(mydata) #2D展示前6行的数据，1D展示前6个数据head(mydata, n=10) #前10行的数据head(mydata, 10) #前10行的数据tail(mydata) #后几行的数据tail(mydata,10) #后10行的数据str(mydata) #所具有的对象的类型，行数，列数，每一个列的数据类型，每一个列的前几个数据colnames(m...
2018-04-11 09:20:33
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原创 [mac] R入门 四 数据可视化
1，plot()plot(mtcars$disp, mtcars$mpg, xlab="Engine displacement", ylab="mpg", main="MPG compared with engine displacement", las=1) #x,y，x、y轴的lable，main是设置标题的，las=1，lable style设置使y轴的刻度旋转90度数字更适合阅读，默认散点...
2018-04-11 09:13:49
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原创 [Mac]R入门 二 ---录入数据
1，显示R中默认存储的数据集，输入数据集的name显示数据集的数据data()2，导入已存在的本地数据数据的分隔是comma时mydata <- read.csv("filename.txt",header=FALSE) #第二个参数缺省，当设置为FALSE时，第一行的数据会读作data，列的header会默认设置，可以修改数据的分隔不是comma时，例如当是tab时mydata <-...
2018-04-08 16:13:48
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原创 [Mac]R入门 一
1，安装R，IDE使用RStudio。先看Leada的R免费课程2，快捷键Tab，自动补齐Command + up，自动补齐。在Console中，同时按住这两个键，显示出之前使用命令列表Command + Enter，运行当前行Control + Enter，选中要运行的行，可多行运行。3，working directorygetwd(), 获取工作目录setwd(), 设定工作目录setwd("...
2018-04-08 10:20:08
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转载 【转载】mac下R语言问题汇总
1， r 在mac中读取clipboard问题 2， office 乱码读取问题1， r 在mac中读取clipboard问题content <- read.table(file=”clipboard”,header=TRUE) #windows Error in file(file, “rt”) : 无法载入X11模块解决方案：Mac： 方法1：read.table(pipe(“pbpas...
2018-04-08 08:35:20
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原创 Mac osx 10.12 下安装cadnano
请使用vpn，安装之前先解决unable to access ‘https://github.com/Homebrew/brew/‘: Failed to connect to github.com，避免安装失败参见http://blog.csdn.net/u010599923/article/details/582101451.1 获取ip,并copy$ ping github.com1.2在／
2017-04-15 21:34:48
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空空如也
空空如也
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