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RSS订阅原创 FSL 2nd&3rd-Level Analysis for task fMRI
设置好后，Contrasts & F-tests里，Contrasts里输入被试数，在矩阵的对角线里填入1；首先，FSL和SPM等其他软件不同，例如SPM在内的二阶分析等同于组分析，但是FSL里的二阶分析是先计算出每个被试的平均激活图谱，因为一阶分析里对每个被试的不同run分别处理的，因此FSL的二阶分析先计算不同run的平均，在三阶分析里再进行组水平的分析。出现Use lower-level copes，分别对应一阶分析里设置的contrast，选择你感兴趣的对比；输入output directory。
2025-02-10 10:23:25
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原创 FSL处理task-fMRI不完全踩坑记录
2. 批处理1st-level analysis时，fsl的文件识别可能有防傻匹配…同样的.nii.gz因为我同时gunzip了，fsl无法区分这两个文件，因此一直报错；最后都把.nii文件删了，脚本才正确完成。BTW，因为event file的问题重新处理了好几遍，一定要记得减去S触发时间，并且两个run的触发时间不一样。1. 我的数据有2个run，run1 save .fsf成功，但是run2一直报错，提示event file无法有效读取。4. 1st-level analysis 脚本出现过的问题。
2025-02-06 17:29:33
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原创 卸载和安装wsl、ubuntu、docker
二、安装Docker ---------------------------------------------------------------------------------------------------------一、安装Ubuntu -------------------------------------------------------------------------------------------------------记录一下全程，欢迎交流。1、先注销我的发行版。
2024-07-11 09:54:56
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原创 fslmaths 二值化掩码、计算mask与atlas的重合度
5、写脚本计算atlas各分区与mask的重合度，并将重合度排序，以此筛选出感兴趣的区域。1、找到激活区域下载.nii文件，制作0-1 mask。3、根据mask，将atlas 0-1化。4、读取atlas分区并生成区域序号。2、将mask重定向到atlas。
2024-05-29 13:01:06
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原创 Ubuntu20.04安装FreeSurfer（HCP pipeline）
FreeSurfer version 5.3.0 只提供linux和max的下载版本。填写注册信息，邮箱将收到版本码（licence.txt)3、下载FreeSurfer压缩包。
2024-03-14 23:57:51
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空空如也
ubuntu20.04 的GUI花屏
2024-02-22
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