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原创 关于医疗影像分割求torch.softmax(z_ul, 1).max(dim=1)

首先解释一下,对于求max,索引恰好相反,对于dim=1,则是在固定dim=0,2的前提下求最大值,如此来说,dim=1则可以视作求哪个channel的概率最大,也就是该体素属于那种器官的概率最大,并且,最终max回返回一个索引,也就是哪个channel的概率最大,这样返回的结果就是0,1,2...,可以直接视为分割结果了!其求的便是按照[0,0,0][0,1,0][0,2,0]的索引进行之后的运算操作,即。先说softmax,对于dim=1,说明是固定了第一维,例如数组[2,3,4]

2024-06-22 22:17:12 156

原创 ISAAC GYM ImportError: libpython3.8.so.1.0: cannot open shared object file: No such file or director

前几天在使用ISAAC GYM中遇到了如下报错:可以通过解决。

2024-06-04 14:21:11 90

原创 医疗影像分割,从3d图像获取2d slice

最近在做有关医疗影像分割的项目,原本使用了3dunet,在BTCV数据集上做实验,但是之后发现很多的官方示例都是在2维影像上使用的,所以研究了一下怎么从3d中提取2d图像。上述连接则是MONAI给出的从3d图像得到2d图像的例程,上述两种方法全都是使用了monai的API,但是我将上述两个例程结合起来的时候容易出问题,大伙其实也可以试试。该项目便是monai给的例程,完全是基于BTCV的raw data来做的。采取的不一样的思路,将3d图像读取后,直接按顺序将每个切片保存。

2024-04-21 19:17:32 706 1

原创 ubuntu配置pytorch以及cuda

ubuntu系统安装一般会自带驱动,在安装NVIDIA驱动以前需要禁止系统自带显卡驱动nouveau:可以先通过指令lsmod | grep nouveau查看nouveau驱动的启用情况,如果有输出表示nouveau驱动正在工作,如果没有内容输出则表示已经禁用了nouveau。重启,就禁止了ubuntu20.04自带的nouveau显卡驱动了,接下来我们就可以安心的安装自己想要的NVIDIA的驱动程序了。sudo update-initramfs -u #应用更改。打开终端,在终端输入下面指令。

2024-04-21 18:54:32 236 2

原创 UBUNTU全流程

之后特别提一下分区的步骤,可以不按视频中的方法,我是直接选择安装ubuntu和windows共存,这种菜鸟的装法反倒比较简便,并且以后也不会有某个分区被占用完的情况。另外,我的这个分区盘符没有很大的参考价值,因为的是加装了1T硬盘。之后可shift+左键点击重启,在接下来的页面选择启动项,一般是你的u盘,反正不是ubuntu那个选项,多试几次就好啦,一般也不会对电脑造成影响。接下来打开ESP(0)中的UBUNTU文件夹,将其中的内容删除,我这里面不知道为啥没有啊,哈哈,反正保证ubuntu里面没东西就好。

2024-04-21 18:50:05 679 1

原创 SLAM学到的小技巧

Unix软件都是绿色的,并没有windows下所谓注册表的说法,所以直接可以删除的。如果没有redis,只能是因为Path环境变量没有包含redis的bin目录。决定默认安装位置的,一般情况下,都是在。命令只是进行了编译,还需要。目录,也可以通过指定。

2024-04-18 15:06:53 124 1

原创 python代码开头指定使用conda环境

则是要执行的程序名。这种方法允许用户使用他们所配置的 Python 解释器,而不是硬编码一个特定的解释器路径。这一行通常出现在脚本文件的开头,告诉操作系统应该使用哪个解释器来执行脚本。是一个可执行文件,它会在系统的 PATH 环境变量中查找后面指定的程序,而。的意思是使用环境变量中指定的 Python 解释器来执行脚本。但是有时候我们执行需要指定conda环境。使得shebang指向conda环境即可。

2023-11-19 09:44:29 432 1

原创 CONDA常用指令

大家好阿,今天给大家带来一些想看的东西阿。查看已经创建的环境 conda env list一、创建虚拟环境conda create --name env_name python=3.5 # 创建指定python版本conda create --name env_name python=3.5 numpy scipy # 创建指定python版本下包含某些包二、激活/使用/进入某个虚拟环境三、退出当前环境deactivate四、复制某个虚拟环境五、删除某个环境。

2023-11-07 15:22:04 128

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