gridengine qsub常用方法

本文介绍了如何使用gridengine的qsub命令提交任务,包括指定工作路径、输出文件、依赖关系和优先级。同时,讲解了使用qstat命令检查作业状态,如运行、挂起、等待状态以及详细信息的获取。还提到了qhost命令用于查看GridEngine集群中各节点的状态。
摘要由CSDN通过智能技术生成

=== 1. 提交任务:`qsub` ===
 * 提交job的最简单命令是:
{ { {
  qsub scriptname
}}}
  `scriptname` 是要执行的任务文件名称,一般是一个bash脚本文件。
  在以上最简单命令的缺省情况下,GridEngine会
   - 在你的 home directory 开始执行job,并以此为基准计算相对路径
   - 将 `stout` 写到名为 `scriptfile.ojobID` 的文件,将 `stderr` 写到 `scriptfile.ejobid`(`scriptfile`是脚本名称,`jobID`是job number。因此如果job number是12345,脚本是“test”,则输出文件为 `test.o12345` and `test.e12345`)
  * 指定工作路径为当前目录
{ { {
  qsub -cwd scriptname
}}}
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