遗传图谱比较

最新推荐文章于 2023-03-24 21:29:21 发布
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分类专栏： 生物信息 R 文章标签： 绘制 遗传图 物理图谱 R
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本文链接：https://blog.csdn.net/msw521sg/article/details/54406194
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本文介绍了用于比较遗传图谱的用户友好应用——Genetic Map Comparator。该工具能够显示和对比遗传地图，虽然图形美观度有限，但提供了一种便捷的方式来展示和分析图谱数据。用户可以通过在线使用或下载安装进行操作，输入文件需要包含染色体名称、标记名称及遗传或物理距离信息。
摘要由CSDN通过智能技术生成

​​​### 遗传图谱比较或者遗传图和物理图谱比较

今天在Bioinformatics杂志上看到一篇关于遗传图谱之间比较的文章，感觉不错，特介绍如下。

题目是：The Genetic Map Comparator: a user-friendly application to display and compare genetic maps

PMID: 28073759 DOI: 10.1093/bioinformatics/btw816

但暂时看不到其论文。但是软件还是可以下载安装或者在在线使用也可以。

网址

当然也可以下载安装，然后在本地运行

命令如下

install.packages(shiny)
library(shiny)
runGitHub("GenMap-Comparator","holtzy")  #会自动下载和安装所需要的包

图谱输入文件格式如下：第一列为染色体名称 第二列为标记名称 第三列为标记的遗传距离或者物理距离。

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