java判断DNA中的指定片段是否重复

//郑州轻工业大学
//题号：实验二 第二题
//题目：DNA可以表示成一系列缩写的核苷酸分子结构，主要为A、C、G、T，例如“ACGAATTCGC”。在研究DNA时，识别DNA中的重复序列有时对研究非常有帮助。编写一个函数来找出DNA序列中带有指定 “GAATTC”重复片段的序列，例如“ACGAATTCGC”中只出现了一次“GAATTC”，不是我们要找的DNA序列，输出“该片段无重复”；而“ACGAATTCGCACGAATTCGC……ACGAATTCGC”出现了超过1次的重复片段，所以输出“该片段有重复”。
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这里我们使用了一个新方法
substring() 方法返回字符串的子字符串。

语法
public String substring(int beginIndex)

或

public String substring(int beginIndex, int endIndex)

具体方法我在下面完整代码注释很详细

import java.util.Scanner;

public class r2{
    public static void main(String[] args) {
        String zhiding="GAATTC";       //指定片段
        String shuru;               //输入片段
        Scanner in=new Scanner(System.in);
        System.out.println("请输入DAN");
        shuru=in.next();
        int a=0;   //统计重复次数
        for (int i=0;;i++){
            if(i+6>shuru.length())       //这个意思是到这段片段的末尾了，再向后就不足指定片段的长度了，所以跳出
                break;
            if(zhiding.equals(shuru.substring(i,i+6)))  //通过比较指定片段与提取片段是否相同来判断
                a=a+1;
        }

        if (a<=1)
            System.out.println("该片段无重复");
        else
            System.out.println("该片段有重复");


    }
}

总地址：郑州轻工业大学实验整合

水平有限，如有错误，还望大神指正；(^_−)☆