R语言
seabird_bai
医学生,想要成为技术人的小白一名
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R语言_安装包时联网失败
遇到的问题:今天在新电脑上,用install.packages()命令安装包,提示无法连接到网络:unable to access index for repository ******cannot open URL ******尝试了各种方法,包括:换镜像:Rstudio-tools-global options-packages-修改“primary CRAN repository”至国内镜像,多换几个试一试。将https改成http:①先用options(repos ="http:原创 2022-04-19 20:31:21 · 1631 阅读 · 1 评论 -
【R语言小技巧】怎样创建行数为0的数据框
1.用data.frame()test=data.frame(col1=character(0),col2=numeric(0),col3=logical(0))#其中character(0),numeric(0),logical(0)定义了对应列的数据类型以及长度为0。如果觉得提前定义类型麻烦,可以先统一定义为一种,之后再转换str(test)#'data.frame': 0 obs. of 3 variables:#$ col1: chr #$ col2: num #$ col3: log原创 2021-09-17 16:46:29 · 1231 阅读 · 0 评论 -
【转录组学】featureCounts软件中的length是怎样计算的?
分析过程以rela基因为例,featureCounts结果文件“all.id.txt”中提供的信息为:Geneid ENSMUSG00000024927Chr 19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19 Start 5687511;568774原创 2021-09-17 14:19:20 · 859 阅读 · 0 评论 -
R_在jupyter_notebook中调用R
系统:win10在电脑中安装R在电脑中安装jupyter notebook在任务栏搜索anaconda prompt并打开对应版本找到R的安装路径,如C:\Program Files\R\R-4.0.2\bin在anaconda prompt中运行cd C:\Program Files\R\R-4.0.2\bin输入R并回车打开R输入install.packages('IRkernel')安装IRkernel安装完成后运行IRkernel::installspec()重新打开jupyte原创 2020-06-27 13:46:42 · 284 阅读 · 0 评论 -
R语言_数据导入_xlsx
方法1:用xlsx包导入,但是文件稍微一大,就提示Java out of memoryjava.lang.OutOfMemoryError: Java heap space方法2:用openxlsx包导入,实测能比xlsx包导入更大的文件方法3:用电子表格软件转化成文本格式,用read.table()导入...原创 2020-05-15 09:40:45 · 1447 阅读 · 0 评论 -
R语言_包的安装_tidyverse
tidyverse是一个集合了ggplot2、dplyr、stringr、tidyr等包的强大的R包安装tidyverse:选择一个中国镜像install.packages("tidyverse")发现,无论是兰州镜像还是广州镜像,都是重启R session,然后安装失败解决问题:方法1:手动安装谷歌搜索tidyverse install cran。选择tidyverse cran官方链接(https://cran.r-project.org/web/packages/tidyver.原创 2020-05-15 09:35:15 · 20097 阅读 · 0 评论 -
R语言_包的安装_xlsx
xlsx是一个用于导入和导出xlsx数据的R包。安装方法:先选择一个中国区的镜像(如果一个下载不了就换一个),然后安装:install.packages("xlsx")加载包:library(xlsx)发现报错:错误: package or namespace load failed for ‘xlsx’: loadNamespace()里算'rJava'时.onLoad失败了,详细内容: 调用: fun(libname, pkgname) 错误: JAVA_HOME can.原创 2020-05-14 15:02:59 · 2749 阅读 · 0 评论 -
R语言_众数
# 创建Get_mode函数用于获取向量的众数Get_mode=function(x){ x_freq_table=as.data.frame(table(x)) max_freq=max(as.vector(x_freq_table[,2])) if (max_freq==1) { return(FALSE) }else{ x_mode=as.numeric...原创 2020-04-17 16:13:24 · 3309 阅读 · 0 评论 -
R语言_大小写的坑
函数中参数的大小写也不能随意mapply()函数data1=as.data.frame(matrix(1:12,nrow=3))data1正确:mapply(sum,SIMPLIFY = TRUE,data1[,1],data1[,2],data1[,4])错误:mapply(sum,simplify=TRUE,data1[,1],data1[,2],data1[,4])...原创 2020-04-11 21:54:09 · 2155 阅读 · 0 评论