【转录组学】featureCounts软件中的length是怎样计算的?

本文通过分析featureCounts结果文件,揭示了其Length值实际上是所有片段合并后的长度。以rela基因为例,经过R语言的计算验证,确认了这一结论。
摘要由CSDN通过智能技术生成

分析过程

  • 以rela基因为例,featureCounts结果文件“all.id.txt”中提供的信息为:
Geneid	ENSMUSG00000024927

Chr 19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19;19	

Start	
5687511;5687747;5687857;5687961;5687972;5687987;5688460;5688460;5688460;5688460;5688579;5688579;5688579;5688579;5688579;5688579;5688883;5688883;5688883;5688883;5688883;5689887;5689887;5689887;5690331;5690331;5690331;5690331;5691174;5691209;5691209;5691209;5691492;5691492;5691492;5691492;5695353;5695353;5695353;5695353;5695541;5695541;5695541;5695541;5696622;5696828;5696828;5696828;5696828	

End	
5687869;5687869;5687869;5688004;5688176;5688176;5688486;5688486;5688486;5688486;5688724;5688730;5688730;5688730;5688730;5688730;5689031;5688997;5689031;5689031;5689031;5689978;5689978;5689978;5690460;5690462;5690462;5690462;5691313;5691313;5691313;5691313;5691704;5691704;5691704;5691704;5695
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