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原创 OHDSI ETL 工具使用 WhiteRabbit + Rabbit in A Hat + Usagi
ETL工具 WhiteRabbit和RabbitinAHat 是帮助准备纵向医疗保健数据库 ETL 到OMOP CDM 的软件工具 . WhiteRabbit 会扫描您的数据并创建一份报告,其中包含开始设计 ETL 所需的所有信息。WhiteRabbit 的主要功能是对源数据进行扫描,提供有关字段中出现的表、字段和值的详细信息 Usagi 是一种帮助手动创建代码映射过程的工具。它可以根据代码描述的文本相似性进行建议的映射。 WhiteRabbit White Rabbit 和 Rabbit in a
2021-11-11 16:42:02
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原创 OHDSI ATLAS 安装
1.1 前提条件 官方文档Atlas Setup Guide · OHDSI/Atlas Wiki · GitHub CDM 样例数据下载Data Standardization – OHDSI VOCABULARY 下载地址Athena 1.1.1 需要的环境 Postgresql 10 (其它版本的可能存在兼容性问题)且硬盘大于100GB Tomcat 8.X (不建议通过manager上传,容易报错,建议使用War包进行部署) R 4.0.X、R Tools 4.0.X且仅安装...
2021-11-11 14:14:51
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空空如也
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