高通量测序
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【转载】扩增子测序序列的引物去除
使用Perl脚本识别并去除扩增子测序序列中的引物和barcode,fastq转fasta,重命名fastq/fasta序列(可被Qiime和Usearch识别样本来源)转载 2023-10-07 12:25:41 · 319 阅读 · 2 评论 -
【转载】扩增子测序数据标准化——随机重抽样(Subsample)
使用perl脚本对高通量测序OTU表/ASV表做序列数目标准化(随机重抽样),计算alpha多样性指数(物种丰富度、均匀度、Shannon、Simpson指数、覆盖度等),计算每个物种的相对丰度。转载 2023-10-07 12:32:08 · 267 阅读 · 0 评论