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原创 GEO基础
GEO分析也是数据挖掘的一部分,目的在于减少基因数量,锁定核心基因。数据挖掘数据来源有不分方向的GEO和NHANES,及肿瘤专属的TCGA,ICGC,CCLE,SEER。类型可包括基因表达芯片,转录组,单细胞,突变,甲基化及拷贝数变异等等。
2024-08-08 16:29:31 277
原创 条件与循环
(1)只有if没有else,那么条件是FALSE时就什么都不做。(3)ifelse 如果是TRUE,则执行第一个。apply()族函数。
2024-08-06 16:22:06 165
原创 R语言画图基础
总论可视:基础包使用不多,不再赘述,如下图:一般以ggplot2和ggpubr为主mapping = aes是映射的意思我们主要以ggplot2为主进行介绍。
2024-08-06 11:03:53 357
原创 数据框、矩阵与列表
R语言中,数据存储依赖于变量,而变量根据维度又有不同的形式。最为常见的即为向量形式,形式为一维。如果针对的是二维的数据形式,如读取表格的数据,则需要数据框、矩阵与列表的形式。
2024-08-03 23:18:21 287
原创 R语言函数与数据类型、向量
按照逻辑值,[]内必须是与X等长的逻辑向量。按照位置,[]内必须是X下标组成的向量。is返回逻辑值,向R提问是否?as是作为的意思,返回转换数值。
2024-07-31 21:56:00 228
原创 R语言你应知道的若干技巧:环境设置/文件读写/报错
在R语言中一般以来Rstudio进行操作。在建立起R project之后,我们需要新建脚本运行代码。一般在脚本中逐行RUN。R project文件夹可以移动,双击Rproj格式文件即可重置默认位置。有关Python的报错不需要管,你可以选择安装,或者找别的教程取消报错。
2024-07-31 21:02:49 250
原创 R语言基础:如何安包?
将Bioconductor镜像设置为使用清华大学的镜像来安装Bioconductor包。: 设置了Bioconductor镜像后,此命令显示更新后的Bioconductor镜像,R将使用它来安装相关包。: 将CRAN镜像设置为使用清华大学的镜像来安装R包。: 显示当前Bioconductor镜像(仓库),R将使用它来安装Bioconductor包。: 显示当前配置的R包安装的仓库选项。默认情况下,它显示当前为R包配置的仓库。: 设置了仓库后,此命令显示更新后的R包安装的仓库选项。
2024-07-31 20:30:57 203
空空如也
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