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gromacs
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popboy126
这家伙很懒
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[鲲鹏920-arm64][Euler OS] gromacs源码编译
文章目录1 编译前准备1.1 下载并导入Euler OS镜像2 制作基础编译环境镜像2.1 修改基础镜像dockerfile2.2 打包镜像3 制作编译环境镜像3.1 修改编译镜像dockerfile3.2 打包镜像参考1 编译前准备本文假设已在目标机器上安装好了docker环境1.1 下载并导入Euler OS镜像访问Euler OS Repo网站,选择相应版本,进入到版本下的的docker_img进行下载。本文使用aarch64的版本的镜像。mkdir -p /data/euler_compi原创 2020-10-15 14:05:02 · 521 阅读 · 0 评论 -
gromacs水分子(spc)全原子力场(opls-aa)模拟
文章目录1 环境需求2 开始模拟2.1 准备模拟目录2.2 生成拓扑文件2.3 生成结构文件2.4 下载参数文件2.5 模拟2.5.1 最小化能量2.5.2 控温(NVT)2.5.3 控压(NPT)2.5.4 模拟参考1 环境需求系统环境: Ubuntu 18.04.4 LTSgromacs版本: 2020.32 开始模拟2.1 准备模拟目录mkdir -p /data/sim/cd /data/sim/2.2 生成拓扑文件echo '#include "oplsaa.ff/forc原创 2020-08-11 18:24:58 · 3931 阅读 · 2 评论