bitmap解析

1.引子

         问题描述:
         输入:一个最多含有n个不重复的正整数(也就是说可能含有少于n个不重复正整数)的文件,其中每个数都小于等于n,且n=10^7。
         输出:得到按从小到大升序排列的包含所有输入的整数的列表。
         条件:最多有大约1MB的内存空间可用,但磁盘空间足够。且要求运行时间在5分钟以下,10秒为最佳结果。

         分析:下面咱们来一步一步的解决这个问题,
         1、归并排序。你可能会想到把磁盘文件进行归并排序,但题目要求你只有1MB的内存空间可用,所以,归并排序这个方法不行。
         2、位图方案。熟悉位图的朋友可能会想到用位图来表示这个文件集合。例如正如编程珠玑一书上所述,用一个20位长的字符串来表示一个所有元素都小于20的简单的非负整数集合,边框用如下字符串来表示集合{1,2,3,5,8,13}:

0 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
上述集合中各数对应的位置则置1,没有对应的数的位置则置0。
          参考编程珠玑一书上的位图方案,针对我们的10^7个数据量的磁盘文件排序问题,我们可以这么考虑,由于每个7位十进制整数表示一个小于1000万的整数。我们可以使用一个具有1000万个位的字符串来表示这个文件,其中,当且仅当整数i在文件中存在时,第i位为1。采取这个位图的方案是因为我们面对的这个问题的特殊性:1、输入数据限制在相对较小的范围内,2、数据没有重复,3、其中的每条记录都是单一的整数,没有任何其它与之关联的数据。
         所以,此问题用位图的方案分为以下三步进行解决:
                      第一步,将所有的位都置为0,从而将集合初始化为空。
                      第二步,通过读入文件中的每个整数来建立集合,将每个对应的位都置为1。
                      第三步,检验每一位,如果该位为1,就输出对应的整数。
         经过以上三步后,产生有序的输出文件。令n为位图向量中的位数(本例中为1000 0000),程序可以用伪代码表示如下:

//第一步,将所有的位都初始化为0
for i ={0,....n}
    bit[i]=0;
//第二步,通过读入文件中的每个整数来建立集合,将每个对应的位都置为1。
for each i in the input file
    bit[i]=1;
//第三步,检验每一位,如果该位为1,就输出对应的整数。
for i={0...n}
	if bit[i]==1
		write i on the output file
           问题:

           用此位图方法,严格说来还是不太行,空间消耗10^7/8还是大于1M(1M=1024*1024空间,小于10^7/8)。
           既然如果用位图方案的话,我们需要约1.25MB(若每条记录是8位的正整数的话,则10000000/(1024*1024*8) ~= 1.2M)的空间,而现在只有1MB的可用存储空间,那么究竟该作何处理呢?

          改进的位图方案,共需要扫描输入数据两次,具体执行步骤如下:
          第一次,只处理1—4999999之间的数据,这些数都是小于5000000的,对这些数进行位图排序,只需要约5000000/8=625000Byte,也就是0.625M,排序后输出。
          第二次,扫描输入文件时,只处理4999999-10000000的数据项,也只需要0.625M(可以使用第一次处理申请的内存)。
          因此,总共也只需要0.625M。

          对应源码如下:

//位图方式解决海量数据排序,数据不能有重复

//使用 C++ stl的 bitset
#include <iostream>
#include <bitset>
#include <assert.h>
#include <time.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
using namespace std;

const int max_each_scan = 5000000;

int main()
{
    clock_t begin = clock();
    bitset<max_each_scan> bit_map;
    bit_map.reset();
    // open the file with the unsorted data
    FILE *fp_unsort_file = fopen("data.txt", "r");
    assert(fp_unsort_file);
    int num;
    
    // the first time scan to sort the data between 0 - 4999999
    while (fscanf(fp_unsort_file, "%d ", &num) != EOF)
    {
        if (num < max_each_scan)
			//有这个数字,将bit_map的对应的位设置为1
			bit_map.set(num, 1);
    }
    FILE *fp_sort_file = fopen("sort.txt", "w");
    assert(fp_sort_file);
    int i;
    // write the sorted data into file
    for (i = 0; i < max_each_scan; i++)
    {
        if (bit_map[i] == 1)
        fprintf(fp_sort_file, "%d ", i);
    }
    
    // the second time scan to sort the data between 5000000 - 9999999
    int result = fseek(fp_unsort_file, 0, SEEK_SET);
    if (result)
		cout << "fseek failed!" << endl;
    else
    {
        bit_map.reset();
		while (fscanf(fp_unsort_file, "%d ", &num) != EOF)
		{
			if (num >= max_each_scan && num < 10000000)
			{
				num -= max_each_scan;
				bit_map.set(num, 1);
			}
		}
		for (i = 0; i < max_each_scan; i++)
		{
			if (bit_map[i] == 1)
				fprintf(fp_sort_file, "%d ", i + max_each_scan);
		}
    }
    clock_t end = clock();

    cout<<"用位图的方法,耗时:"<<endl;
    cout << (end - begin) / CLK_TCK << "s" << endl;
    fclose(fp_sort_file);
    fclose(fp_unsort_file);
    return 0;
}

2.bitmap原理

          所谓的Bit-map就是用一个bit位来标记某个元素对应的Value, 而Key即是该元素。由于采用了Bit为单位来存储数据,因此在存储空间方面,可以大大节省。

          假设我们要对0-7内的5个元素(4,7,2,5,3)排序(这里假设这些元素没有重复)。那么我们就可以采用Bit-map的方法来达到排序的目的。要表示8个数,我们就只需要8个Bit(1Bytes),首先我们开辟1Byte的空间,将这些空间的所有Bit位都置为0,如下图:


         然后遍历这5个元素,首先第一个元素是4,那么就把4对应的位置为1(可以这样操作 p+(i/8)|(0×01<<(i%8)) 当然了这里的操作涉及到Big-ending和Little-ending的情况,这里默认为Big-ending),因为是从零开始的,所以要把第五位置为一(如下图):


         然后再处理第二个元素7,将第八位置为1,,接着再处理第三个元素,一直到最后处理完所有的元素,将相应的位置为1,这时候的内存的Bit位的状态如下:


         然后我们现在遍历一遍Bit区域,将该位是一的位的编号输出(2,3,4,5,7),这样就达到了排序的目的。下面的代码给出了一个BitMap的用法:排序。

//定义每个Byte中有8个Bit位
#include <memory.h>
#include <stdio.h>

#define BYTESIZE 8

void SetBit(char *p, int posi)
{
	for(int i=0; i < (posi/BYTESIZE); i++)//找出所在字节
	{
		p++;
	}

	*p = *p|(0x01 << (posi%BYTESIZE));//将该Bit位赋值1
	return;
}

void BitMapSortDemo()
{
	//为了简单起见,我们不考虑负数
	int num[] = {3,5,2,10,6,12,8,14,9};
	int i;

	//BufferLen这个值是根据待排序的数据中最大值确定的
	//待排序中的最大值是14,因此只需要2个Bytes(16个Bit)
	//就可以了。
	const int BufferLen = 2;
	char *pBuffer = new char[BufferLen];

	//要将所有的Bit位置为0,否则结果不可预知。
	memset(pBuffer,0,BufferLen);

	for(i=0; i < 9; i++)
	{
		//首先将相应Bit位上置为1
		SetBit(pBuffer,num[i]);
	}

	//输出排序结果
	for(i=0;i < BufferLen;i++)//每次处理一个字节(Byte)
	{
		for(int j=0;j < BYTESIZE;j++)//处理该字节中的每个Bit位
		{
			//判断该位上是否是1,进行输出,这里的判断比较笨。
			//首先得到该第j位的掩码(0x01<<j),将内存区中的
			//位和此掩码作与操作。最后判断掩码是否和处理后的
			//结果相同
			if((*pBuffer&(0x01 << j)) == (0x01 << j))
			{
				printf("%d ",i*BYTESIZE + j);
			}
		}
		pBuffer++;
	}
}

int main(int argc, char * argv[])
{
	BitMapSortDemo();
	return 0;
}


参考:

1.http://www.kuqin.com/algorithm/20111006/312574.html

2.http://blog.redfox66.com/post/2010/09/26/mass-data-4-bitmap.aspx

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