Ubuntu+hdf5+netcdf-c+petsc库安装与使用

安装zlib

下载地址：ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/netcdf-4/
Shell下安装指令：

wget http://prdownloads.sourceforge.net/libpng/zlib-1.2.11.tar.gz

tar -zxf zlib-1.2.11.tar.gz

sudo ./configure

sudo make && make install

安装curl

安装hdf5

hdf5是为了使用netcdf-4特性，这个特性需要hdf5来支持，这个特性支持2G以上的文件。
下载地址：[ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/netcdf-4/]
Shell下安装指令：

cd hdf5-X.Y.Z
./configure --prefix=/path/to/hdf5  --with-zlib=/path/to/zlib#安装路径

make

make check                # run test suite.

make install

make check-install        # verify installation.

安装netcdf-c

下载地址 ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/old/
Shell下安装指令：

CPPFLAGS=-I/path/to/netcdf4-needed/include 
LDFLAGS=-L/path/to/netcdf4-needed/lib 
./configure --prefix=/usr/local/netcdf4-needed --disable-dap

注意：此处如果没有输入 --disable-dap的话，要预先安装curl. dap应该是用于远程数据处理相关的,这里不安装也行。

安装fftw

wget http://www.fftw.org/fftw-3.3.8.tar.gz

tar xzvf fftw-3.3.8.tar.gz

cd ./fftw-3.3.8

./configure --enable-shared

make

sudo make install

sudo ldconfig

安装petsc

参考文献

[1] ubuntu18.04下安装zlib方法
[2]Netcdf4.4的安装过程（附netcdf4.1.3的安装过程）
[3]ubuntu下安装NetCDF之HDF4/HDF5对NetCDF的支持