【linux】Netcdf4安装

踩坑记录，看中文社区的文章来配环境简直就是掘shit… 失败了好多次，痛定思痛以后一定要直接去谷歌

全流程走过一遍没有问题，希望大家能少踩坑

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参考文章：https://zhuanlan.zhihu.com/p/563570353

核心就是要把--prefix都装到一个目录下

fortran 安装

#检查是否已安装 gfortran

which gfortran

#如果没有任何返回内容，使用 APT 工具安装 gfortran

sudo apt install -y gfortran

#检查 gfortran 版本

gfortran --version
#由于 APT 源中可能根据系统版本不同提供的最新 gfortran 版本也不同，可以自定义添加源安装最新 gcc 10

sudo add-apt-repository ppa:ubuntu-toolchain-r/test

sudo apt update

sudo apt install gfortran-10

以下程序均在root权限下进行的安装。

进入root： sudo -s 然后输入密码

安装zlib

下载地址：http://www.zlib.net/

cd进入zlib所下载的文件夹后，解压 tar -zxvf zlib-1.2.12.tar.gz

进入zlib-1.2.12文件夹，配置安装信息：

./configure --prefix=/usr/local/netcdf4（usr文件夹创建是需要root或者sudo）

编译：make

检查：make check

安装：sudo make install

安装完成之后会在/usr/local/netcdf4这个目录下生成三个文件lib include share

安装slib

好像不用装也行，我是没有装，照样可以用

安装hdf5

下载地址：https://portal.hdfgroup.org/display/support/HDF5+1.12.0#files

解压 tar -zxvf hdf5-1.12.0.tar.gz

配置安装信息.

./configure --prefix=/usr/local/netcdf4 --with-zlib=/usr/local/netcdf4/

编译：make

检查：make check

安装：sudo make install

安装curl

地址: https://curl.se/download/

解压 tar -zxvf curl-7.85.0.tar.gz

安装curl
CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4/include LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4/lib ./configure --prefix=/usr/local/netcdf4

如果出现报错就加上 --without-ssl
configure: error: select TLS backend(s) or disable TLS with --without-ssl.

CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4/include LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4/lib ./configure --prefix=/usr/local/netcdf4 --without-ssl

CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4/include：设置了 C 预处理器的选项-I表示要包含的头文件路径
LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4/lib：设置了链接器的选项，-L 指定链接器要搜索库文件的路径

编译：make

检查：make check

安装：sudo make install

安装netcdf-c

下载地址 https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/

这里我看评论区说4.8.0安装不太行，会出现这个错
configure: error: HDF5 was not built with API compatibility version v18. Please recompile your libhdf5 install using '--with-default-api-version=v18'.
我直接换成了4.9.2版本

解压 tar -zxvf netcdf-c-4.9.2.tar.gz

配置安装信息

CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4/include LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4/lib ./configure --prefix=/usr/local/netcdf4 --disable-dap

我之前好像还报了一个xml的错，根据提示把参数加上好，但是换了一个服务器又没有这个错了，玄学…

原者注：sudo apt-get install m4
(如果提示没有m4的话，否则可以不执行。安装完成后，重新执行上一步配置安装信息。然后再进行编译。)

这个m4问题我没有遇到

编译：make

检查：make check

安装：sudo make install

安装netcdf-fortran

下载地址：https://downloads.unidata.ucar.edu/netcdf/

告知库文件位置.终端中输入:

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/netcdf4/lib:${LD_LIBRARY_PATH}

解压tar -zxvf netcdf-fortran-4.9.0.tar.gz

CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4/include LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4/lib ./configure --prefix=/usr/local/netcdf4 --disable-dap

编译：sudo make

检查：sudo make check

安装：sudo make install

环境变量

bashrc中添加

终端输入：vim ~/.bashrc

打开.bashrc文件后在最后添加

export NETCDF=/usr/local/netcdf4

export PATH=$NETCDF/bin:$PATH

export CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4/include

export LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4/lib

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/netcdf4/lib:${LD_LIBRARY_PATH}

添加完成

终端运行：source ~/.bashrc

完毕

测试：ncdump

源码包相关

这种软件包里面都是源程序，没有编译过，经过编译后才能安装。

需要注意的是，make编译后里面文件会发生改变，如果想要重装建议删除文件夹重新解压再编译然后配置安装信息，不然可能会报错！

安装

1）先解压并切换到文件夹

tar -zxvf ***.tar.gz

tar -jxvf ***.tar.bz(或bz2)

2）./configure #配置#

3）make #调用make#

4）make install #安装源代码#

5）make clean 删除安装时产生的临时文件

卸载

1）进入安装时的目录

2）make uninstall #卸载#

注意：make install命令过程中的安装目录，或者阅读安装目录里面的readme文件，当然最好的办法是在安装的过程中指定安装目录，即在/configure命令后面加参数--prefix，如：./configure --prefix=/usr/local/aaaa,即把软件装在/usr/local/路径的aaaa这个目录里。一般的软件的默认安装目录在/usr/local或者/opt里，可以到那里去找找。指定安装目录以后，当我们不需要这个软件时，直接删除软件的目录就行了。