文献引文分析利器HistCite使用教程（附精简易用免安装Pro版本下载）

最新推荐文章于 2022-10-18 20:23:13 发布

白羊座青草莓

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如果你选修过中国科学技术大学罗昭锋老师的《文献管理与信息分析》，那么你一定不会对HistCite 感到陌生，这是一款非常强大的引文分析工具，可以快速绘制出某个研究领域的发展脉络，快速锁定某个研究方向的重要文献和学术大牛，还可以找到某些具有开创性成果的无指定关键词的论文。

如果说一次引用表示给你的文章投一票，那么并不是所有票都有效，只有相同领域文章的引用才能真正体现你在这个领域中的实力。所以在 Web of Science （以下简称WOS）上按照被引次数倒序排列，越靠前不一定就越重要。还有一种情况，你发明了某种材料，但是后来名字变了，之后的文章使用的关键词都是新名字，别人搜新名字关键词是搜不到你的开创性文章的，但是很显然你的文章是非常重要的。通过 HistCite 可以直观的看出这个研究领域的论文全部引用了你的文章，可以体现你的文章的重要性。

好了，话不多说，下面开始使用这个工具。首先要了解一点，HistCite这款软件是Thomson Reuters公司开发的，和WOS是一家公司，所以HistCite只支持WOS数据库。

打开WOS，注意数据库要选择核心合集（Core Collection）！

例如简单检索一下石墨烯在锂离子电池负极中的应用：

检索结果不是太多，可以全部导出，如果文献太多的话，可以先按照被引频次降序排列，只导出前2000篇就差不多了。

下面开始导出文献信息，点击页面上的【保存至 Endnote Online】按钮右边的下拉按钮，选择【保存为其他文件格式】。

在弹出的菜单中，记录数填写1到500，因为每次最多只能导出500篇文献，所以上面的2819篇文献需要分成6次导出，后面导出的时候依次填写501到1000、1001到1500等等。。。记录内容选择【全记录与引用的参考文献】，文件格式选择【纯文本】，然后点击发送即可得到导出的txt文件，类似可以导出其他5个。

注意：含500个记录的txt文档一般是3M左右，如果你的只有几百K，请仔细按照上面这张图进行导出！！！

下面使用HistCite来分析这6个txt格式的引文数据文件。由于HistCite多年不更新，现在存在各种Bug，比如直接打开HistCite，一加载文件就报错：No such file or directory

尝试第二种方法。选中所有的 txt 文件，然后拖到 HistCite 的图标上，放开鼠标，果然自动打开了软件。

但是，事情好像并没有那么简单，又出现了一个报错：Format Unknown。

最后，在罗老师的指引下，我将每个txt文件的第一行中的Science改成了Knowledge。然后再将txt文件拖放到HistCite图标上面打开，终于成功加载了！

可以看到2819篇文献信息全部加载进来了。

在受到这么多折磨之后，我用 Python 开发了一个方便使用的脚步，于是一个以 HistCite 源程序为核心的精简易用免安装版本问世了，就叫 HistCite Pro 吧。

由于 HistCite 源程序只支持 Windows 系统，所以 Pro 版本也只能在 Windows 下使用。非常方便，只要下载就可以直接用，不用安装，而且去掉了很多没用的文件，大大缩小了软件体积。对于从WOS上导出的txt数据文件，不用做任何修改，只要把全部的txt放到TXT文件夹里面，然后双击main.exe即可一键完成加载，非常方便。

HistCite Pro 下载链接见文末。

好了，数据加载完毕，下面开始分析数据吧，点击Tools菜单下的Graph Maker。
在弹出的页面上点击 Make Graph 即可得到一张引文关系图，包含了最有价值的前30篇文章的完整引文关系。

这张图看起来不是很清楚，在左边的Size选项中选择Full模式，重新绘制一张高清图，然后右击图片“另存为”一张图片即可。

图上有30个圆圈，每个圆圈表示一篇文献，中间的数字是这篇文献在数据库中的序号。圆圈越大，表示被引用次数越多。不同圆圈之间有箭头相连，箭头表示文献之间的引用关系。多数情况下，你会看到最上面有一个圆圈较大，并有很多箭头指向这篇文章。那么这篇文章很可能就是这个领域的开山之作。

通过我绘制出的这张关系图，我们发现标号为29、49、56、60的四个大圆圈非常显眼，可见这四篇文献的被引次数都是非常高的，我们对全部文献进行按照LCS排序，发现前四位刚好就是这4篇文献。

再回到那张圆圈箭头关系图，可见石墨烯在锂离子电池负极材料中的应用研究主要起源于2008年（29号文献），其通讯作者Honma来自日本，看来日本在石墨烯电池方面的研究开展得相当早。之后，在2010年，很多原创性的成功迸发而出，具有代表性的就是49、56、60、48号文献，非常有趣的是，2010年诺贝尔物理学奖的获奖项目刚好是石墨烯，其中的关联显而易见。之后的几年，石墨烯在锂离子电池负极方面的研究越来越多，方向约越来越细。

好了，前面提到HistCite可以找到某些具有开创性成果的无指定关键词的论文，我们来看看是怎么办到的。点击页面上的【Cited References】，然后就可以看到本地库中文献参考的全部文献信息，后面带有加号的表示本地txt库中没有包含，这些往往就是被遗漏的重要文献。

同样的，我们点击上面的【Authors】按钮，可以找到本领域的一些大牛，具体的操作步骤读者可以自己去摸索。

那么我们怎么把文献记录导出到Endnote呢？首先点击菜单栏中【Tools】下的【Mark&Tag】选项，调出标记选择工具栏。

下图红框内就是标记选择工具栏。左边栏用于指定选择范围，可以选择当前列表中的全部文献，也可以按照序号（#）、LCS、LCR等数值的区间来选择文献，还可以手动勾选需要的文献。中间栏表示的是需要导出的信息范围，可以只导出记录本身，也可以选择导出引用的文献或者被引的文献。右边栏的【Mark】按钮就是确认选择按钮。

所以，我们选择好了需要导出的文献记录，点击【Mark】按钮。

然后，我们就会发现上面出现了一个新的标签【Marks】，后面的数字就是我们选中的记录条数，如果发现这个数字不正确，点击【Mark】按钮旁边的【Unmark】来重新选择。确认无误之后，点击图示的【Marks】标签链接，即可显示全部被选的文献记录。

好的，下面依次点击【File】、【Export】、【Records...】来导出选中的文献记录。

成功导出后得到一个.hci格式的文本文件，直接修改后缀为txt。如果导出不成功，一般多尝试几次就可以。

好的，现在我们打开Endnote，依次点击【File】、【Import】、【File...】按钮。

在弹出的对话框中通过【Choose...】找到刚才的txt文件，【Import Option】选择 Multi-Filter (Special)，【Duplicates】选择 Import All，然后点击【Import】按钮即可导入。

评论中沈曦同学提到了将 HistCite 选好的文献导入到 Noteexpress 软件里的方法，具体操作是在导入时将过滤器选择为 web of science。

最后附上HistCite里面几个重要的英文缩写（感谢Dingledodies同学）：

GCS（global citation score），某一文献在WOS数据库中的总被引用次数。有些引用这篇参考文献的文章可能和你的研究方向毫无关系，但GCS还是会把这个引用数据记录下来。

LCS（local citation score），某一文献在本地数据集中的被引用次数。因为你导入Histcite的文章都是和你检索词有关系的，可以认为这些文章是你的研究同行，因此如果某一篇文献的LCS值很高，就意味着它是你研究领域内的重要文献，很有可能是你领域内的开创性文章，注意LCS高的文献和GCS高的文献不一定是同一篇！

LCR（local cited references），某一文献引用本地数据集中参考文献的数目。根据LCR值的排序，可以快速定位近期关注该领域的重要文献，因为某一篇文献引用当前数据集中的文献数越多，说明它非常关注你检索的这个研究方向的文献，和你的研究肯定有相似或者可参考之处，可以从该文章中发现新动向。

CR（cited references），某一文献引用WOS数据库中参考文献的数目。这个值越高，说明这篇文献很可能是综述性文献，可根据该值的排序，也可快速定位综述文献。

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【2016年5月16日更新】

首先给每一位用户朋友真诚地说声谢谢！同时感谢罗老师的大力推广！

不过，也有少数用户反馈了这个软件存在的问题：HistCite可以启动，但是不会自动打开浏览器窗口，或者打开的是一个空白窗口，或者可以打开窗口但是显示的条目数为0，即没有成功导入数据。

这个问题的根源，其实是HistCite本身存在的设计缺陷（毕竟这么多年没有更新了），在少部分电脑上会出现导入数据不成功或者打不开窗口的情况。所以我研究了另外一种导入数据的方法，并采用Python的多线程成功实现了ADV模式，基本可以解决绝大部分兼容性问题。

如果你的电脑不存在上述兼容性问题，你不用在乎这个ADV模式，直接输入YES即可完成数据的读取。如果你的电脑出现了上述导入不成功的问题，你就可以输入ADV，回车之后会读取txt文件，然后自动启动HistCite内核。

HistCite启动之后会自动打开一个IE内核的浏览器窗口（记为A窗口），而这个窗口显示我们导入的Records数量为0，即没有成功导入数据。所以在ADV模式下，HistCite Pro会自动调用系统默认浏览器在5秒后再打开一个窗口（记为B窗口）进行数据的导入，等导入完成之后，你可以将A窗口关闭，在B窗口里面分析数据，或者按F5键刷新A窗口也是可以分析数据的。