11-提升R语言程序性能gc()

0.美图

1. 性能测评

时间测定方法

R中提供的测量时间最简单的方法是system.time函数。

system.time(expr, gcFirst=TRUE)

这个函数会在不降低程序运行性能的情况下，执行表达式expr，gcFrist则是指定程序运行前是否先执行垃圾回收。

> do.stuff <- function(){  
+ a <- 1:100000  
+ for(i in 1:100000){  
+            a[i] <- a[i]^2  
+ }  
+ a  
+ }  
> system.time(do.stuff())  
用户 系统 流逝 
0.14 0.00 0.14 
> 

监控内存方法

R中函数gc()，有两个功能，一是立即执行一次垃圾清理，二是显示剩余内存的统计信息。

> gc()
         used (Mb) gc trigger (Mb) max used (Mb)
Ncells 352070 18.9     750400 40.1   592000 31.7
Vcells 742731  5.7    2263796 17.3  2260755 17.3
> 

used是当前使用情况，gc trigger是会触发垃圾回收的值，max used是上次gc()操作或者是此次启动R后使用最大值。