提升R语言程序性能

1.       性能测评

时间测定方法

R中提供的测量时间最简单的方法是system.time函数。

system.time(expr, gcFirst=TRUE)

这个函数会在不降低程序运行性能的情况下，执行表达式expr，gcFrist则是指定程序运行前是否先执行垃圾回收。

do.stuff <- function(){
a <- 1:100000
for(i in 1:100000){
           a[i] <- a[i]^2
}
a
}
system.time(do.stuff())

监控内存方法

R中函数gc()，有两个功能，一是立即执行一次垃圾清理，二是显示剩余内存的统计信息。

gc()

used是当前使用情况，gc trigger是会触发垃圾回收的值，max used是上次gc()操作或者是此次启动R后使用最大值。(Mb)是Ncells和Vcells的大小转换为Mb单位时的值。

Ncells即cons cells，32位R中占28B，64位R中占56B，我是用的32位的R，所以2616689*28/(1024^2) = 69.9。

Vcells即vector cells，占8B，所以63817864*8/(1024^2) = 486.9。

不是很懂Ncells和Vcells分别指的是R中的什么对象，网上也没找到很确切的说法，所以不知道应该怎么去翻译它们，有知道的朋友希望能告知，谢谢！

 

R中object.size()函数可以查看每个对象占用内存数。

object.size(1)
object.size(train)