Matlab进阶绘图第32期—小提琴图(Violin Chart)

​小提琴图结合了箱线图与核密度图的特征,可用于展示多组数据的分布状态及概率密度

由于Matlab中未收录小提琴图的绘制函数,因此需要大家自行解决。

本文在violin工具(Hoffmann H, MathWork, 2015)的基础上,对一些局部细节进行修改,从而进行小提琴图的绘制,先来看一下成品效果:

特别提示:本期内容『数据+代码』已上传资源群中,加群的朋友请自行下载。有需要的朋友可以关注同名公号【阿昆的科研日常】,后台回复关键词【绘图桶】查看加入方式


1. 数据准备

此部分主要是读取原始数据并初始化绘图参数

% 读取数据load data.mat% 初始化绘图参数data = Y;

2. 颜色定义

作图不配色就好比做菜不放盐,总让人感觉少些味道。

但颜色搭配比较考验个人审美,需要多加尝试。

这里直接使用TheColor配色工具中的SCI权威配色库

%% 颜色定义map = TheColor('sci',1006);C = map(1:5,1:3);

3. 小提琴图绘制

调用‘violin’命令,绘制初始小提琴图

violin(data,'x',1:size(data,2),...      % x坐标刻度            'facecolor',C, ...          % 面颜色            'edgecolor','k',...         % 轮廓颜色            'facealpha',0.8,...         % 透明度            'bw',0.2,...                % 核函数带宽Kernel bandwidth            'mc',[],...                 % 平均值线颜色            'medc','k');                % 中位数线颜色hTitle = title('Violin plot');hXLabel = xlabel('Samples');hYLabel = ylabel('\Delta [yesno^{-2}]');

4. 细节优化

为了插图的美观,对图形细节等进行美化

% 坐标轴美化set(gca, 'Box', 'off', ...                                        % 边框         'LineWidth',1,...                                        % 线宽         'XGrid', 'off', 'YGrid', 'off', ...                      % 网格         'TickDir', 'out', 'TickLength', [.005 .005], ...         % 刻度         'XMinorTick', 'off', 'YMinorTick', 'off', ...            % 小刻度         'XColor', [.1 .1 .1],  'YColor', [.1 .1 .1],...          % 坐标轴颜色         'XTick', 1:5,...                                         % 坐标区刻度、范围         'Xticklabels',{'Sample1','Sample2','Sample3','Sample4','Sample5'},...         'XLim', [0 6],...         'YLim',[-3.5 6])set(gca, 'FontName', 'Arial', 'FontSize', 10)set([hXLabel, hYLabel], 'FontSize', 11, 'FontName', 'Arial')set(hTitle, 'FontSize', 12, 'FontWeight' , 'bold')% 背景颜色set(gcf,'Color',[1 1 1])% 添加上、右框线xc = get(gca,'XColor');yc = get(gca,'YColor');unit = get(gca,'units');ax = axes( 'Units', unit,...           'Position',get(gca,'Position'),...           'XAxisLocation','top',...           'YAxisLocation','right',...           'Color','none',...           'XColor',xc,...           'YColor',yc);set(ax, 'linewidth',1,...        'XTick', [],...        'YTick', []);

设置完毕后,以期刊所需分辨率、格式输出图片。

%% 图片输出figW = figureWidth;figH = figureHeight;set(figureHandle,'PaperUnits',figureUnits);set(figureHandle,'PaperPosition',[0 0 figW figH]);fileout = 'test';print(figureHandle,[fileout,'.png'],'-r300','-dpng');

以上。

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