【GPU】Nvidia CUDA 编程高级教程——利用蒙特卡罗法求解近似值（NVSHMEM）

从善若水

已于 2022-12-17 23:05:18 修改

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分类专栏： GPU 文章标签： CUDA NVIDIA GPU

于 2022-12-17 23:00:16 首次发布

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本人就职于国际知名终端厂商，负责modem芯片研发。
在5G早期负责终端数据业务层、核心网相关的开发工作，目前牵头6G算力网络技术标准研究。

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利用蒙特卡罗法求解 𝜋 的近似值（NVSHMEM）

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NVSHMEM

NVSHMEM是一个并行编程模型，用于在多个 NVIDIA GPU 之间进行高效和可扩展的通信。NVSHMEM 依托于 OpenSHMEM 构建而成，可为横跨多个 GPU 内存的数据提供全局地址空间，并可通过细粒度的由 GPU 发起的操作、由 CPU 发起的操作和 CUDA 流操作访问该空间。NVSHMEM 为许多应用提供了令人信服的多 GPU 编程模型，对于具有高密度 GPU 和复杂互连的现代 GPU 服务器（例如NVIDIA DGX A100 服务器的 NVIDIA NVSwitch）来说尤其有价值。

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为什么使用NVSHMEM

传统上，涉及多服务器 GPU 的通信模式可能看起来如下所示：计算发生在 GPU 上，而通信在同步 GPU 后发生在 CPU 上（确保数据发送有效）。虽然这种方法很容易编程，但会在应用的关键路径上引入初始化通信或启动核函数的延迟。我们会丧失计算与通信重叠的能力。如果我们通过流水操作工作来重叠通信和计算，延迟确实可以部分地隐藏，但代价是让应用变得更加复杂。

请添加图片描述

相反，在使用 GPU 而不是 CPU 启动的通信模型中，我们直接利用 GPU 同时进行计算和通信。我们可以用这种方式编写细粒度的通信模式，并且可以通过 GPU 架构的本质来隐藏通信延迟（在 GPU 架构中，计算中的Warp可以继续进行，而其他的Warps则会停下来等待数据）。

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启动NVSHMEM应用

与 MPI 一样，NVSHMEM 也是具有 SPMD 编程风格的示例之一。NVSHMEM 提供了一个启动脚本¹，其名为nvshmrun，可用于处理启动 𝑀 个进程。nvshmrun的参数是-np，也就是要启动的进程数，然后是应用程序的可执行文件，然后是该可执行文件的任何参数。每个独立进程又名为处理单元 (PE)，有一个唯一的（零索引的）数字标识符与之相关联²。

请添加图片描述

初始化及终止 NVSHMEM

作为主机端的核心需求，我们必须初始化并终止 NVSHMEM，将这两者作为程序中的第一项和最后一项。

nvshmem_init();
...
nvshmem_finalize();

获取处理单元的 ID

API 调用 nvshmem_my_pe() 返回每个 PE 的唯一数字 ID。

int my_pe = nvshmem_my_pe();
int device = my_pe;
cudaSetDevice(device);

在多节点环境中，您必须考虑到一个事实，即 CUDA 设备在每个节点中始终都是零索引的。在这种情况下，您将获得仅对该节点有意义的本地 PE 标识符。例如，如果我们使用两个节点，每个节点有四个 GPU，那么我们将要求工作启动程序在每个节点上运行四个任务（如nvshmrun -np 8 -ppn 4 -hosts hostname1,hostname2），然后完成³：

int my_pe_node = nvshmem_team_my_pe(NVSHMEMX_TEAM_NODE);
int device = my_pe_node;
cudaSetDevice(device);

编译 NVSHMEM 代码

编译看起来和以前相似，但我们现在需要为 NVSHMEM 指向相关的文件包含命令include和库目录（-I $NVSHMEM_HOME/include -L $NVSHMEM_HOME/lib -lnvshmem）以及 CUDA 驱动 API 中的链接（-lcuda）。我们还需要把#include <nvshmem.h>⁴ 和 #include <nvshmemx.h>⁵ 添加到代码中。最后，我们需要添加-rdc=true以启用 浮动设备代码，这是 NVSHMEM 的一项需求。

练习1：使用带有 MC π 代码的 NVSHMEM

#include <iostream>
#include <curand_kernel.h>

#include <nvshmem.h>
#include <nvshmemx.h>

inline void CUDA_CHECK (cudaError_t err) {
    if (err != cudaSuccess) {
        fprintf(stderr, "CUDA error: %s\n", cudaGetErrorString(err));
        exit(-1);
    }
}

#define N 1024*1024

__global__ void calculate_pi(int* hits) {
    int idx = threadIdx.x + blockIdx.x * blockDim.x;

    // 初始化随机数状态（网格中的每个线程不得重复）
    int seed = 0;
    int offset = 0;
    curandState_t curand_state;
    curand_init(seed, idx, offset, &curand_state);

    // 在 (0.0, 1.0] 内生成随机坐标
    float x = curand_uniform(&curand_state);
    float y = curand_uniform(&curand_state);

    // 如果这一点在圈内，增加点击计数器
    if (x * x + y * y <= 1.0f) {
        atomicAdd(hits, 1);
    }
}


int main(int argc, char** argv) {
    // 初始化 NVSHMEM
    nvshmem_init();

    // 获取 NVSHMEM 处理元素 ID
    int my_pe = nvshmem_my_pe();

    // 每个 PE（任意）选择与其 ID 对应的 GPU
    int device = my_pe;
    CUDA_CHECK(cudaSetDevice(device));

    // 分配主机和设备值
    int* hits;
    hits = (int*) malloc(sizeof(int));

    int* d_hits;
    CUDA_CHECK(cudaMalloc((void**) &d_hits, sizeof(int)));

    // 初始化点击次数并复制到设备
    *hits = 0;
    CUDA_CHECK(cudaMemcpy(d_hits, hits, sizeof(int), cudaMemcpyHostToDevice));

    // 启动核函数进行计算
    int threads_per_block = 256;
    int blocks = (N + threads_per_block - 1) / threads_per_block;

    calculate_pi<<<blocks, threads_per_block>>>(d_hits);
    CUDA_CHECK(cudaDeviceSynchronize());

    // 将最终结果复制回主机
    CUDA_CHECK(cudaMemcpy(hits, d_hits, sizeof(int), cudaMemcpyDeviceToHost));

    // 计算 pi 的最终值
    float pi_est = (float) *hits / (float) (N) * 4.0f;

    // 打印结果
    std::cout << "Estimated value of pi on PE " << my_pe << " = " << pi_est << std::endl;
    std::cout << "Relative error on PE " << my_pe << " = " << std::abs((M_PI - pi_est) / pi_est) << std::endl;

    free(hits);
    CUDA_CHECK(cudaFree(d_hits));

    // 最终确定 nvshmem
    nvshmem_finalize();

    return 0;
}

编译和运行命令如下：

nvcc -x cu -arch=sm_70 -rdc=true -I $NVSHMEM_HOME/include -L $NVSHMEM_HOME/lib -lnvshmem -lcuda -o nvshmem_pi_step1 exercises/nvshmem_pi_step1.cpp
nvshmrun -np $NUM_DEVICES ./nvshmem_pi_step1

您运行了首个 NVSHMEM 程序，但很遗憾，我们所做的工作没什么意思，因为每个 PE 都执行同样的工作。（您可通过比较所有 PE 的输出来检查这句话是否正确。）理想情况下，我们希望将工作分散到不同的 PE 和 GPU 上。

练习2：跨 PE 分配工作

在本练习中，每个 GPU 将 𝑁 个样本点除以 PE 的数量 𝑀 。我们可以使用 API nvshmem_n_pes()来获得：

int n_pes = nvshmem_n_pes();

然后将 𝑁 除以 n_pes就行了。为了让PE的工作更有意思，我们执行一个额外的步骤，即为每个 PE 选择各自唯一的随机数的种子，这样可以让每个 GPU 做不同的工作：

int seed = nvshmem_my_pe();

#include <iostream>
#include <curand_kernel.h>

#include <nvshmem.h>
#include <nvshmemx.h>

inline void CUDA_CHECK (cudaError_t err) {
    if (err != cudaSuccess) {
        fprintf(stderr, "CUDA error: %s\n", cudaGetErrorString(err));
        exit(-1);
    }
}

#define N 1024*1024

__global__ void calculate_pi(int* hits, int seed) {
    int idx = threadIdx.x + blockIdx.x * blockDim.x;

    // 初始化随机数状态（网格中的每个线程不得重复）
    int offset = 0;
    curandState_t curand_state;
    curand_init(seed, idx, offset, &curand_state);

    // 在 (0.0, 1.0] 内生成随机坐标
    float x = curand_uniform(&curand_state);
    float y = curand_uniform(&curand_state);

    // 如果这一点在圈内，增加点击计数器
    if (x * x + y * y <= 1.0f) {
        atomicAdd(hits, 1);
    }
}


int main(int argc, char** argv) {
    // 初始化 NVSHMEM
    nvshmem_init();

    // 获取 NVSHMEM 处理元素 ID 和 PE 数量
    int my_pe = nvshmem_my_pe();
    int n_pes = nvshmem_n_pes();

    // 每个 PE（任意）选择与其 ID 对应的 GPU
    int device = my_pe;
    CUDA_CHECK(cudaSetDevice(device));

    // 分配主机和设备值
    int* hits;
    hits = (int*) malloc(sizeof(int));

    int* d_hits;
    CUDA_CHECK(cudaMalloc((void**) &d_hits, sizeof(int)));

    // 初始化点击次数并复制到设备
    *hits = 0;
    CUDA_CHECK(cudaMemcpy(d_hits, hits, sizeof(int), cudaMemcpyHostToDevice));

    // 启动核函数进行计算
    int threads_per_block = 256;
    int blocks = (N / n_pes + threads_per_block - 1) / threads_per_block;

    int seed = my_pe;
    calculate_pi<<<blocks, threads_per_block>>>(d_hits, seed);
    CUDA_CHECK(cudaDeviceSynchronize());

    // 将最终结果复制回主机
    CUDA_CHECK(cudaMemcpy(hits, d_hits, sizeof(int), cudaMemcpyDeviceToHost));

    // 计算 pi 的最终值
    float pi_est = (float) *hits / (float) (N / n_pes) * 4.0f;

    // 打印结果
    std::cout << "Estimated value of pi on PE " << my_pe << " = " << pi_est << std::endl;
    std::cout << "Relative error on PE " << my_pe << " = " << std::abs((M_PI - pi_est) / pi_est) << std::endl;

    free(hits);
    CUDA_CHECK(cudaFree(d_hits));

    // 最终确定 nvshmem
    nvshmem_finalize();

    return 0;
}

编译和运行命令如下：

nvcc -x cu -arch=sm_70 -rdc=true -I $NVSHMEM_HOME/include -L $NVSHMEM_HOME/lib -lnvshmem -lcuda -o nvshmem_pi_step2 exercises/nvshmem_pi_step2.cpp
nvshmrun -np $NUM_DEVICES ./nvshmem_pi_step2

在这里插入图片描述

nvshmrun本质上是一个到 Hydra 流程管理器的符号链接。虽然我们演示了 NVSHMEM 在独立运行的计算机中的使用情况，但 NVSHMEM 可与 MPI 作业启动环境兼容，比如它也可以与 Slurm 一起使用。如果使用 MPI 或 OpenSHMEM 启动作业，则相关代码修改如下所示。对于 MPI，我们首先初始化 MPI，然后在 MPI 上引导 NVSHMEM 初始化。关闭时，我们要先终止 NVSHMEM，然后终止 MPI。

int main() {
    MPI_Init(&argc, &argv);

    nvshmemx_init_attr_t attr;
    MPI_Comm comm = MPI_COMM_WORLD;
    attr.mpi_comm = &comm;

    nvshmemx_init_attr(NVSHMEMX_INIT_WITH_MPI_COMM, &attr);

    // ...

    nvshmem_finalize();

    MPI_Finalize();

    return 0;
}

在 OpenSHMEM 作业中，我们会改用以下做法

int main() {
    shmem_init();

    nvshmemx_init_attr_t attr;
    nvshmemx_init_attr(NVSHMEMX_INIT_WITH_SHMEM, &attr);

    // ...

    nvshmem_finalize();

    shmem_finalize();

    return 0;
}

↩︎

NVSHMEM 作为 OpenSHMEM 的实现，有许多术语都与 OpenSHMEM 相通（如 PE），并具有非常相似的 API。熟悉 MPI 的读者会发现 PE 类似于 MPI rank。 ↩︎
API nvshmem_team_my_pe() 是 NVSHMEM 2.0 中的新功能。请查看这篇博客，了解更多信息。 ↩︎
nvshmem.h提供符合 OpenSHMEM 标准的 API，类似于 nvshmem_*。 ↩︎
nvshmemx.h提供 NVIDIA 专用的扩展程序，类似于nvshmemx_*。 ↩︎

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【GPU】Nvidia CUDA 编程高级教程——利用蒙特卡罗法求解近似值（NVSHMEM）

`NVSHMEM`是一个并行编程模型，用于在多个 NVIDIA GPU 之间进行高效和可扩展的通信。**NVSHMEM 依托于 OpenSHMEM 构建而成**，可为横跨多个 GPU 内存的数据提供全局地址空间，并可通过细粒度的由 GPU 发起的操作、由 CPU 发起的操作和 CUDA 流操作访问该空间。NVSHMEM 为许多应用提供了令人信服的多 GPU 编程模型，对于具有高密度 GPU 和复杂互连的现代 GPU 服务器（例如NVIDIA DGX A100 服务器的 NVIDIA NVSwitch）来说
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