医学成像相关
二亩三分地
这个作者很懒,什么都没留下…
展开
-
医学影像批量配准(matlab,SPM)
医学影像批量配准,matlab 代码配准后的文件与配准前的文件保存在统一目录下,命名以‘r’开头。文件目录nii_path的组织方式,见链接:https://blog.csdn.net/qq_34869928/article/details/110003619%-----------------------------------------------------------------------% Job saved on 21-Nov-2019 15:35:09 by cfg_u..原创 2020-11-23 19:58:00 · 2920 阅读 · 2 评论 -
Dicom批量转nii(医学影像格式转换,SPM)
Dicom转nii(医学影像格式转换)实验中需要用spm12进行配准,spm12 配准只能导入nii格式,但医生给的影像是dicom格式的,需要先进行格式转换。spm12有自带的dicom转nii功能,但需要一例一例影像点着来,费时费力枯燥,好在基于SPM12可以写出代码批量转换!!!1. 在matlab上安装好spm12,安装方法可参考smp12官网2. 文件组织方式 dicom path:保存所有dicom的目录,该目录下是一个一个的病例,每个病例的影像分开保...原创 2020-11-23 18:38:47 · 9390 阅读 · 6 评论 -
MedGAN——用GAN对医学成像进行迁移
该网络结构的论文是——MedGAN:Medical Image Translation using GANsMedGAN结构如下图所示:一、 MedGAN由三部分组成:1. 生成器(Generator)——选用一个CasNet(Fig.2)做生成器,输入为 y(如PET),输出为(如CT)。2. 判别器(Discriminator)——用于区分真实图像 x 和转化图像,同时...翻译 2019-05-28 17:11:30 · 2539 阅读 · 3 评论 -
Medical Image Synthesis with Context-Aware Generative Adversarial Networks (简介)
本文是关于MRT-to-CT。 首先,提出一个基本的三维FCN结构来估计从MRI得到的CT图像。三维操作可以更好地对三维空间信息进行建模,从而可以解决切片间的不连续问题。其次,利用对抗式训练策略对所设计的网络进行训练。还在生成器的损失函数中加入了一个图像梯度差项(image gradient difference),目的是保持产生的CT的锐度。最后,使用Auto-Conte...翻译 2019-05-28 19:59:05 · 1362 阅读 · 3 评论 -
Adversarial Stain Transfer for Histopathology Image Analysis(简介)
组织病理学分析中的对抗染色迁移 本文所提出方法的目标是为给定的组织病理学图像分析任务(例如,分类或分割)建立一个带有内在染色归一化组件的判别模型。这种模型应该能够处理具有不同统计特性的图像(即,不同染色表现),不需要额外的训练或预处理。 染色也可以看作是分割任务。一、该论文中提出的网络结构: :用于训练的图片,来自病理学实验室A。 ...翻译 2019-06-07 20:24:42 · 580 阅读 · 4 评论 -
Translating and Segmenting Multi-modal Medical Volumes with Cycle- and Shape-Consistency GAN(简介)
这篇论文提出了医学volume-to-volume的转换,包括对抗性、循环一致性和形状一致性损失,以及双模态分割。这篇论文主要用到CycleGAN。一、本论文提出的方法上图描述了该结构的两个部分:生成器部分和分割器部分(判别器部分没有特别之处,所以没介绍)1. 生成器部分: 两个生成器,采用U-Net结构,使用步长为2、核为3×3×3的卷积进行3次下采样,上...翻译 2019-06-11 11:39:06 · 935 阅读 · 0 评论