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原创 knn算法中的函数
Numpy模块:from numpy import *#将numpy函数库中所有模块引入当前的命名空间numpy中包含了数组和矩阵两种数据类型tile 函数:tile(inx,(x,y))# tile 将原矩阵横向、纵向地复制# inx 表示被操作对象,一般为数组或矩阵# (x,y)括号里面的参数表明横向,纵向铺陈的维数例如:对于矩阵lxlx = array([[1, 2...
2019-04-04 16:06:15 1199
原创 上传本地文件到github
上传的前提是:已经申请注册了github账号电脑上已经安装了git已经在自己的账号下搞好了SSH主要说明上传的命令:4. 在本地创建库:把需要上传的文件放入一个文件夹,例如test5. 打开git bash进入该文件夹:6. bash中输入 git init #把这个目录变成Git库成功之后,会出现一个.git的文件,如果看不到,点击显示隐藏文件7. bash中输入:...
2019-03-28 16:46:23 136
原创 利用NCBI的序列号下载所有样本的说明信息
例如文章中提到:来自该研究的所有RNA-seq数据可通过NCBI序列阅读档案(SRA)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra)下载,登录号为SRR2089755。进入该网站搜索该序列号,如图选中所有样本,点击send to点击run selecter,点击go,进入如下页面选中所有样本,点击runinfo table就得到所有样本的患病信息...
2019-02-27 22:15:06 4286
原创 七桥上实现CIBERSORT的前期准备工作
在docker中使用shell命令切割文本目的输入文本格式如下:gene_id normalized_countA1BG|1 30.5653A1CF|29974 99.4377…希望将上述文本中“|”后半部分删除,只保留“|”前部分内容和空格后面部分内容,且将第一行第一列的表头“gene_id”改成“Gene symbol”,最后输出为新的“.txt”文本输出文本内容格...
2018-11-14 00:29:54 4199
空空如也
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