wavewatch3_4.18 安装netcdf4过程记录

声明：2019.5.13 目前对于wavewatch4.18版本，虽然都安装成功了，但是在w3_make的时候仍然会报错，正在解决此问题

先供上两篇参考教程

https://blog.csdn.net/schumacher2016/article/details/80850240

https://blog.csdn.net/zhaohaibo_/article/details/88249104

https://blog.csdn.net/tuhuolong/article/details/7843352

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        WAVEWATCH3需要调用netcdf，netcdf4.1.3以后需要手动安装，zlib，hdf5，netcdf-c，netcdf-fortran，且后一个分别依赖前一个，因此要按顺序安装。

        之前在服务器上远程安装了NETCDF4.6.2，已安装成功，但是在运行WAVEWATCH3_4.18编译程式ww3_ounf时，会出现错误，现将netcdf重新安装，版本4.3.2，主要参考黄学智教程https://blog.csdn.net/schumacher2016/article/details/80850240。

        以下安装为centos7系统，root用户

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1. 指定临时编译环境（本人用的gcc，gfortran）

export CC=gcc
export CXX=g++
export FC=gfortran
export F77=gfortran
export F90=gfortran

1. 安装curl（wavewatch3 4.18好像需要，5.16好像不需要）

mkdir netcdf #存放下载文件文件夹
wget ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/netcdf-4/curl-7.26.0.tar.gz
tar -zxvf curl-7.26.0.tar.gz
cd curl-7.26.0
./configure --prefix=/usr/local/netcdf4-needed
make
make check
make install

2.安装zlib

cd netcdf
wget ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/netcdf-4/zlib-1.2.8.tar.gz 
tar -zxvf zlib-1.2.8.tar.gz
cd zlib-1.2.8/
./configure --prefix=/usr/local/netcdf4-needed
make
make check
make install #若无报错，则安装成功
cd ..

3. 安装hdf5

hdf5需要用到zlib文件

wget ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/netcdf-4/hdf5-1.8.13.tar.gz
tar -zxvf hdf5-1.8.13.tar.gz
cd hdf5-1.8.13
./configure --prefix=/usr/local/netcdf4-needed --with-zlib=/usr/local/netcdf4-needed/
make
make check  %如果报错了，则尝试 make & make check ,也许可以，官方说这是这个版本的bug
make install

4. 安装netcdf-c

先加环境变量到 LD_LIBRARY_PATH中（安装netcdf-c可以暂时不加，但是安装netcdf-fortran必须添加）

 export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/netcdf4-needed/lib:$LD_LIBRARY_PATH

# 或者wget ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/old/netcdf-4.3.2.tar.gz
wget https://github.com/Unidata/netcdf-c/archive/v4.3.2.tar.gz #github下载速度较快
tar -zxvf v4.3.2.tar.gz
cd  v4.3.2.tar.gz    
./configure --prefix=/usr/local/netcdf4-needed --disable-dap CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4-needed/include LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4-needed/lib  #CPPFLAGS配置安装信息，指定c++头文件位置;  #LDFLAGS配置安装信息，指定编译优化信息位置
make
make check
make install

5. 安装netcdf-fortran

wget https://github.com/Unidata/netcdf-fortran/archive/v4.4.0.tar.gz
tar -zxvf v4.4.0.tar.gz
cd netcdf-fortran-4.4.0/
./configure --prefix=/usr/local/netcdf4-needed CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4-needed/include LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4-needed/lib
make
make check
make install

6. 配置环境变量，非常重要的一步

如果只是当前用户使用，则将环境变量路径信息加入~/.bashrc中，并source ~/.bashrc; 如果是系统全局，则加入/etc/bashrc，并重启系统

export NETCDF=/usr/local/netcdf4-needed

export PATH=$NETCDF/bin:$PATH

export LD_LIBRARY_PATH=$NETCDF/lib:$LD_LIBRARY_PATH

export CPPFLAGS='-I/usr/local/netcdf4-needed/include'

export LDFLAGS='-L/usr/local/netcdf4-needed/lib'
 

对于WAVEWATCH而言，还要加入关于netcdf的配置说明，才能使wavewatch正常使用netcdf4

export WWATCH3_NETCDF=NC4
export NETCDF_LIBDIR=/usr/local/netcdf4-needed/lib
export NETCDF_INCDIR=/usr/local/netcdf4-needed/include
export NETCDF_CONFIG=/usr/local/netcdf4-needed/bin/nf-config

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后续2019.5.22

命运多舛，我在ubuntu18.01 lts ( window10子系统，试了两个Ubuntu18 )上安装时，按照上述过程，在安装netcdf-c时会报错：

configure: error: Can't find or link to the z library. Turn off netCDF-4 and      opendap with --disable-netcdf-4 --disable-dap, or see config.log for errors

初步判断，猜测是zlib没有安装好，或者是netcdf-c在安装时没有配置好安装路径，导致其找不到z library， 几小时后，，，还是没解决，经过查询，发现hdf5用了zlib，参照这篇教程，再加这篇，换了一个版本netcdf-c，问题仍是存在，看起来似乎和操作系统有关系？

后续2019.5.23

回到centos7.0上再试一次，以普通用户安装，在安装时使用sudo授予管理员权限，然后，，在安装netcdf-fortran时，提示：configure: error: netcdf.h could not be found. Please set CPPFLAGS.，喜大普奔！经过查询，解决了该问题，参考气象家园一篇回答，将./configure ... CPPFLAGS... LDFLAGS... 写在一行上，且./configure在第一位

再后续：2019.5.23

在使用wavewatch3 4.18的命令ww3_ounf时，提示： NetCDF: Unknown file format，用ncdump命令打开nc文件时，有的会提示NetCDF: Unknown file format，经查询，按照官网说明，应该是和netcdf-c的版本有关系，应安装netcdf-c 4.5以上版本。

再再后续：2019.5.25

在另外一次安装时，发现在安装到netcdf-fortran时，会提示找不到libnetcdf的某个库文件，经查询，应该是在安装netcdf-fortran时，没有指定到netcdf-c的库文件位置，但是实际上我也指定了，后来将 LD_LIBRARY_PATH的设定放到了 ./configure后面（和CPPFLGAS LDFLAGS 同一行），好像可以解决问题。但同时我也更换了netcdf-c的版本号，不知道和哪个有关系，先记录下来，也希望有了解的人指导下。