R Markdown运行Python

R Markdown——绝不只R

R Markdown、RStudio可能背了名字的锅，咋一看总让人以为是R的专属编辑器，但R Markdown和RStudio绝不止R，还可以编写Python、Julia、C、JavaScript、SQL等等。如下图打开RStudio，可以建立Python、C、C++、JavaScript、HTML等文件。

同时，R Markdown 也支持PDF、Word、PPT、网页等多种输出格式 ，绝对的编辑利器啊！

R Markdown的安装与配置

安装RStudio

Rstudio的安装与更新可以到官网链接下载，选择Free的RStudio Desktop即可。

Rstudio v1.12版本及以上支持直接创建Python文件，可以直接新建Python File，进行Python的编写与运行。不知道有多少和我一样从R转Python的人，这波操作简直太良心了！转到Python，一切也都还是熟悉的配方:）

PS：笔者最近网很慢，所以直接下载预计用时大概要十几个小时… 如果有盆友和笔者一样悲惨的话，可以先下载XunLei（https://www.xunlei.com），再用它下载RStudio。如此一来，笔者大概1分钟内下载好了RStudio。

配置R Markdown

在RStudio中的console中运行install.packages("rmarkdown")，安装rmarkdown包。

install.packages("rmarkdown")

生成PDF需要LaTex或tinytex包，这里强烈推荐安装tinytex包！

理由如下：

1. tinytex安装简单，仅需两行代码；
2. tinytex体积小，仅一百多兆，而􏴅􏳫􏰎 LaTeX发行版都超级大，􏳘􏳫􏲔􏴅􏴆􏰄􏴇􏴈􏴉􏳮􏰂􏰒动则几个G；􏰷
3. tinytex能自动安装LaTex缺失的包，可以多次编译文档，tinytex::latexmk()能帮你搞定常见的LaTex问题。

在RStudio中的console中运行install.packages("tinytex")和tinytex::install_tinytex()，安装tinytex。

install.packages("tinytex")
tinytex::install_tinytex()

RStudio中配置Python

在RStudio中运行python代码，需要reticulate包，同样是install.packages("reticulate")。

install.packages("reticulate")

在R Markdown中编译Python

新建一个Rmd文件，在其中的代码块中先输入{python, engine.path= '/opt/anaconda3/bin/python'}指定使用的Python版本，即可进行python脚本的编译。笔者这里使用之前安装的anaconda中的Python。具体路径可以在cmd中输入which python或whereis python获得。

```{python, engine.path= '/opt/anaconda3/bin/python'}
import sys
print(sys.version)

点击Knit即可进行编译，编译过程及结果：

R Markdown的实时编译

可以安装写轮眼xaringan，再调用函数 xaringan::inf_mr() 或者 RStudio 插件 “Infinite Moon Reader” 皆可开启实时预览：只需要保存当前的 Rmd 文件，写轮眼会自动重新编译它并刷新结果。

xfun::pkg_load2('xaringan')

对写轮眼幻灯片来说，究极无限月读更是可以让你一边打字一边预览。再也不用猛击Knit 按钮了！
注意：只支持 HTML 输出格式（因为背后涉及到 JavaScript 技术）。

参考链接：
[1]:如何配置R Markdown以及在R Markdown中配置python
[2]: 谢益辉：R Markdown 技能杂谈