imageJ基本操作

这篇文章会针对图像拼接的各种情况,介绍ImageJ中不同的自动图像拼接方法。

自动图像拼接大概可以分为以下三种情况:

一、图片无重叠

二、图片有规律重叠

三、图片无规律重叠

下面会针对这三种情况,介绍不同的解决方案。
一、图片无重叠

这种情况并不多见,通常运用于理想情况下,图片无重叠分割后,重新拼接。

(1)对于无重叠的两张图片(Stack),如下图所示

图片拼接方法(Image -> Stacks -> Tools -> Combine)

这里的情况需要横向拼接,如果要纵向拼接,可以勾选Combine vertically,拼接结果:

2)对于无重叠的平铺扫描的一系列图片,如下图所示:

图片拼接方法(Plugins -> Stitching -> Grid/Collection stitching)

进行平铺扫描的图片拼接时,必须要知道扫描的方式(Type),方向(Order),这里的扫描方式是由左到右,由上到下,所以选择Grid: row-by-row,Right&Down。

以及这组图片在x、y上的Grid size,即每行每列有几张图,这里总共有98张图片,x轴上每行14张图片,y轴上每列7张图片。初始化窗口如下:

重点注意红框中的参数:

Directory:定义图片文件夹路径,待拼接的图片需要放入一个文件夹。

First file index i:定义i的初始值,这里定义i的初始值为1。

File name for tiles:读取命名为tile_{i}.tif的图片,这里的{i}是可变参数。

不要勾选Compute overlap,因为图片之间没有重叠。

拼接结果:

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