Windows使用Ubuntu的经验小结

wsl的使用

#在cmd中操作

wsl
# 打开ubuntu

wsl --list
# 显示当前的linux版本

wsl --shutdown
# 关闭linux系统

wsl -l -v
# 显示当前的liunx系统运行情况

linux的使用命令

1.文件操作命令

cd /home 进入 '/ home' 目录' 

cd .. 返回上一级目录 

cd ../.. 返回上两级目录 

cd 进入个人的主目录 

cd ~user1 进入个人的主目录 

cd - 返回上次所在的目录 

pwd 显示当前工作路径 

ls 查看目录中的文件 

ls -F 查看目录中的文件 

ls -l 显示文件和目录的详细资料 

ls -a 显示隐藏文件 

ls *[0-9]* 显示包含数字的文件名和目录名 

tree 显示文件和目录由根目录开始的树形结构

lstree 显示文件和目录由根目录开始的树形结构

mkdir dir1 创建一个叫做 'dir1' 的目录

mkdir dir1 dir2 同时创建两个目录 

mkdir -p /tmp/dir1/dir2 创建一个目录树 

rm -f file1 删除一个叫做 'file1' 的文件' 
 
rmdir dir1 删除一个叫做 'dir1' 的目录' 

rm -rf dir1 删除一个叫做 'dir1' 的目录并同时删除其内容 

rm -rf dir1 dir2 同时删除两个目录及它们的内容 

mv dir1 new_dir 重命名/移动 一个目录 

cp file1 file2 复制一个文件 

cp dir/* . 复制一个目录下的所有文件到当前工作目录 

cp -a /tmp/dir1 . 复制一个目录到当前工作目录 

cp -a dir1 dir2 复制一个目录 

ln -s file1 lnk1 创建一个指向文件或目录的软链接 

ln file1 lnk1 创建一个指向文件或目录的物理链接 

touch -t YYMMDDhhmm file1 修改一个文件或目录的时间戳

iconv -l 列出已知的编码 

 2.文件搜索

find / -name file1 从 '/' 开始进入根文件系统搜索文件和目录 
 
find / -user user1 搜索属于用户 'user1' 的文件和目录 
 
find /home/user1 -name \*.bin 在目录 '/ home/user1' 中搜索带有'.bin' 结尾的文件 
 
find /usr/bin -type f -atime +100 搜索在过去100天内未被使用过的执行文件 
 
find /usr/bin -type f -mtime -10 搜索在10天内被创建或者修改过的文件 
 
find / -name \*.rpm -exec chmod 755 '{}' \; 搜索以 '.rpm' 结尾的文件并定义其权限 
 
find / -xdev -name \*.rpm 搜索以 '.rpm' 结尾的文件，忽略光驱、捷盘等可移动设备 
 
locate \*.ps 寻找以'.ps'结尾的文件
 
whereis halt 显示一个二进制文件、源码或man的位置 
 
which halt 显示一个二进制文件或可执行文件的完整路径 
 

相关软件使用

1.xfce4

并打开VcXsrv Server

startxfce4
# 启动xfce4远程桌面

2.Conda

2.1虚拟环境管理

# 查看现有的环境
$ conda info --env

# 创建环境，后面的python=3.6是指定python的版本
$ conda create --name env_name python=3.6
 
# 创建包含某些包的环境（也可以加上版本信息）
$ conda create --name env_name python=3.7 numpy scrapy
 
# 激活某个环境
$ conda activate env_name
 
# 关闭某个环境
$ conda deactivate
 
# 复制某个环境
$ conda create --name new_env_name --clone old_env_name
 
# 删除某个环境
$ conda remove --name env_name --all
 
# 生成需要分享环境的yml文件（需要在虚拟环境中执行）
$ conda env export > environment.yml
 
# 别人在自己本地使用yml文件创建虚拟环境
$ conda env create -f environment.yml

2.2包管理

# 列出当前环境下所有安装的 conda 包。
$ conda list
 
# 列举一个指定环境下的所有包
$ conda list -n env_name
 
# 查询库
$ conda search scrapys
 
# 安装库安装时可以指定版本例如：（scrapy=1.5.0）
$ conda install scrapy
 
# 为指定环境安装某个包
$ conda install --name target_env_name package_name
 
# 更新安装的库
$ conda update scrapy
 
# 更新指定环境某个包
$ conda update -n target_env_name package_name
 
# 更新所有包
$ conda update --all
 
# 删除已经安装的库也尅用（conda uninstall）
$ conda remove scrapy
 
# 删除指定环境某个包
$ conda remove -n target_env_name package_name
 
# 删除没有用的包
$ conda clean -p

3.Pymol

pymol
# 启动pymol

run PyMOLRosettaServer.py
# 启动Pymol-RosettaServer服务

4.Jupyter

jupyter notebook
# 启动jupyter notebook

5.Pyrosetta

https://rosettacommons.github.io/PyRosetta.notebooks/