研究成果
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南开大学_生物大数据实验室
南开大学 生物大数据实验室账号,主要用于展示课题组的研究成果。
实验室主要从事于机器学习、特征选择、生物信息学等方向的研究。
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[Database] CPMCP: a database of Chinese patent medicine and compound prescription
现有的中医药相关数据库,都主要聚焦于单一药材的属性,远远不能满足临床研究和应用的需要。相比之下,中医复方在中国传统医学中更具有临床价值。因为中医复方除了考虑相对孤立的单一药材外,还要考虑中药材间的配伍信息。药材的配伍机制在中医中是必不可少的,因为它不仅体现了治疗特殊疾病所涉及的成分,而且还对如何组合这些单一的药材进行了指导。 我们建立了中成药及复方制剂数据库(简称CPMCP)。展示了中成药(CPMs)和中医古方(CMPs)的处方信息。CPMCP报告了它们全面和标准化的信息,如成分、适应症和禁忌症。值得一提的原创 2023-01-18 00:40:41 · 281 阅读 · 0 评论 -
Autoencoder-based DTI prediction by preserving the consistency of chemical properties and functions
本文提出了一种基于自动编码器的方法(AEFS),通过保持药物相关性在化学属性空间、分子机制空间和临床功能空间中的分布相一致来预测药物的可能靶点。实验表明,AEFS具有强大的发现未知DTI的能力,并且它对不平衡的数据的鲁棒性更强。其性能在多个评价指标下都显著的优于几个SOTA方法。原创 2023-01-17 22:42:27 · 152 阅读 · 0 评论