R_install
参考
[genomicranges的学习]https://www.it610.com/article/1288783044492206080.htm
Anaconda安装R语言解释器及第三方包
打开Anaconda控制台,输入
conda install R
即可安装解释器,安装在你的Anaconda的Lib目录下,一个名叫R的文件夹内,例如我的就在E:\anaconda\Lib\R里。
安装pkg
R方式【推荐使用】
进入R环境(> R);类似在cmd中进入python然后写代码的那步
chooseCRANmirror()
install.packages(“BiocManager”)
使用:
BiocManager::install(“pkg”)
conda方式
若要安装第三方包,则输入
conda install -c r r-包名
例如,安装极富盛名的ggplot2包的指令为
conda install -c r r-ggplot2
手动安装
https://www.w3cschool.cn/r/r_packages.html
转到链接R Packages下载所需的包。 将包作为.zip文件保存在本地系统中的适当位置。
install.packages(file_name_with_path, repos = NULL, type = "source")
# Install the package named "XML"
install.packages("E:/XML_3.98-1.3.zip", repos = NULL, type = "source")
装载包到库中
在包可以在代码中使用之前,必须将其加载到当前R环境中。 您还需要加载先前已安装但在当前环境中不可用的软件包。
使用以下命令加载包:
library("package Name", lib.loc = "path to library")
# Load the package named "XML"
install.packages("E:/XML_3.98-1.3.zip", repos = NULL, type = "source")
更新
更新(R方式):
library(“rvcheck”)
rvcheck::update_all()
update.packages( )