AiZynthFinder详解:如何使用基于蒙特卡洛树搜索的神经网络逆合成规划工具

1. 引言

随着计算机科学和化学的交叉融合,逆合成已成为药物研发和化学领域的热门话题。逆合成不仅可以帮助化学家找到合成某种化合物的方法,而且还可以大大减少实验时间和成本。AiZynthFinder是这一领域的先锋工具之一,它结合了蒙特卡洛树搜索和神经网络的能力,为化学家提供了一个强大的逆合成规划平台。


2. AiZynthFinder 简介

AiZynthFinder是一个逆合成规划工具,它使用蒙特卡洛树搜索来递归地分解分子,直到找到可购买的前体。在这个过程中,一个特定的策略指导着这个搜索。这个策略的特殊之处在于,它利用了一个在已知反应模板库上训练的神经网络来建议可能的前体。


3. 蒙特卡洛树搜索简介

在深入研究AiZynthFinder如何工作之前,我们首先需要理解蒙特卡洛树搜索(MCTS)的基本原理。

MCTS是一个决策过程,经常用于现实世界的模拟,例如在棋类游戏中。这个算法可以进行大量的模拟试验,然后基于这些试验的结果来做出决策。

MCTS包括以下几个步骤:

  1. 选择:从根节点开始,根据某种策略选择一个子节点,直到找到一个未被完全扩展的节点。
  2. 扩展:在当前节点增加一个或多个子节点。
  3. 模拟:从当前节点开始进行一个随机模拟,直到模拟结束。
  4. 回溯:根据模拟的结果࿰
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